RNA–Protein interactions for RNA: YOL080C

REX4, Transcript of Putative RNA exonuclease, yeast

Gene REX4, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX4	YOL080C	HXT14	P42833	540 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	GWT1	P47026	490 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MDE1	P47095	244 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YGL108C	P53139	140 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RRN9	P53437	365 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RCF2	P53721	224 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YNR062C	P53748	327 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	PRM1	P53835	661 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	ARL3	Q02804	198 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RSN1	Q03516	953 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	TRM82	Q03774	444 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	VHS1	Q03785	461 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YMR155W	Q03795	547 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	SOV1	Q04748	898 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
REX4	YOL080C	SGT1	Q08446	395 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	SLD7	Q08457	257 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YPR063C	Q12160	140 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	SKS1	Q12505	502 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RGS2	Q99188	309 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RAD10	P06838	210 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MET2	P08465	486 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	ERG3	P32353	365 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	GYP6	P32806	458 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	SUR1	P33300	382 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	JEN1	P36035	616 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MRPL15	P36523	253 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	SDS24	P38314	527 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YBP1	P38315	674 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	AVT6	P40074	448 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	PIB2	P53191	635 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	CAF40	P53829	373 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	CTF19	Q02732	369 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YDR249C	Q03787	373 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	ESA1	Q08649	445 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	HIR3	P47171	1648 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	QCR2	P07257	368 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	DST1	P07273	309 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	IFM1	P25038	676 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	GIT1	P25346	518 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MSN4	P33749	630 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	STB6	P36085	766 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RRN10	P38204	145 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MMS4	P38257	691 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YDR089W	P38966	869 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	FRT2	P39734	528 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	FMC1	P40491	155 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YJR030C	P47101	745 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	IBA57	P47158	497 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	UFD1	P53044	361 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	PRM15	Q03262	622 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	GPI17	Q04080	534 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MHR1	Q06630	226 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MFG1	Q07684	458 aa		3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	REV3	P14284	1504 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	QCR7	P00128	127 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	GAL7	P08431	366 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	COS2	P0CX12	379 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	COS3	P0CX13	379 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	HEM15	P16622	393 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MNE1	P24720	663 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	CNB1	P25296	175 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	TFC1	P32367	649 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	DPH2	P32461	534 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MNS1	P32906	549 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	CLG1	P35190	452 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	DAD2	P36162	133 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	MRPL3	P36516	390 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	FMP23	P38231	175 aa		3.72	□□□□□ -1.81
REX4	YOL080C	RFC3	P38629	340 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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