RNA–Protein interactions for RNA: YMR305C

SCW10, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW10, Length 1,170 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW10	YMR305C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	UIP4	Q08926	304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	GUP2	Q08929	609 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ACF2	Q12168	779 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SEC12	P11655	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SAC7	P17121	654 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SNF6	P18888	332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	PHO80	P20052	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	RIB7	P33312	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	MBA1	P38300	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	NVJ1	P38881	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	STB1	P42845	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	FET5	P43561	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	MDE1	P47095	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	IBA57	P47158	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	COS10	P52924	374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YGL235W	P53071	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YGL101W	P53144	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	COS1	P53822	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	OST6	Q03723	332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YML053C	Q04978	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YPS7	Q06325	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ATG33	Q06485	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	CRT10	Q08226	957 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YCK1	P23291	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YCR100C	P25606	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ORC2	P32833	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	PTR2	P32901	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YPT7	P32939	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	TOD6	P34219	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YHR035W	P38769	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	CHL4	P38907	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	HIS6	P40545	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SMK1	P41808	388 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	GDS1	P41913	522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	QRI7	P43122	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	TOS2	P50078	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	FIN1	Q03898	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	PLM2	Q04383	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	PEX10	Q05568	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	VID22	Q05934	901 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	STP3	Q05937	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	PCL9	Q12477	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	QCR7	P00128	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	MET2	P08465	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	HMG1	P12683	1054 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	HSP30	P25619	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	IMG1	P25626	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	PTC6	P25646	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ARO7	P32178	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SPT14	P32363	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
SCW10	YMR305C	RCN1	P36054	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	VPS51	P36116	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YBR063C	P38083	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	EXO84	P38261	753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	YHK8	P38776	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ANS1	P38832	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ICE2	P40499	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	APS3	P47064	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	BNA5	Q05979	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCW10	YMR305C	DIC1	Q06143	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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