RNA–Protein interactions for RNA: YGL246C

RAI1, Transcript of Nuclear protein with decapping endonuclease activity, yeast

Gene RAI1, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAI1	YGL246C	SEO1	P39709	593 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	AIM33	Q04516	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	NFI1	Q12216	726 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	QCR6	P00127	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	GRR1	P24814	1151 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
RAI1	YGL246C	SOL2	P37262	315 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	BMT2	P38278	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YHR182W	P38870	785 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YGL262W	P53054	175 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	KTR6	P54070	446 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	FAR1	P21268	830 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	MRPS9	P38120	278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	HEM14	P40012	539 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YGR018C	P53211	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YNL143C	P53908	130 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	FSH2	Q05015	223 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	PGC1	Q08959	321 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	ATP16	Q12165	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	CCH1	P50077	2039 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	MAS1	P10507	462 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	HMX1	P32339	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	ECT1	P33412	323 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	RRF1	P38771	230 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	EFM3	P47163	339 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	VTI1	Q04338	217 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	UNG1	P12887	359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	SIF2	P38262	535 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YHR122W	P38829	231 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	PEX22	P39718	180 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	LST7	P53237	242 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	UBA3	Q99344	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	LYS2	P07702	1392 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	FAB1	P34756	2278 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	WSC4	P38739	605 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	AQR1	P53943	586 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YNL050C	P53952	270 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	SMP3	Q04174	516 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	CKI1	P20485	582 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	SAG1	P20840	650 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YJR030C	P47101	745 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	ECM11	Q04110	302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	MCH1	Q07376	486 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YDL012C	Q12489	107 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	STE3	P06783	470 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	COS9	P36034	407 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	RBG1	P39729	369 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YHC3	P47040	408 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	GAS2	Q06135	555 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	GLE1	Q12315	538 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	LDB17	Q12342	491 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	PMT2	P31382	759 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	MRPS5	P33759	307 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	SHE1	P38200	338 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	ATG7	P38862	630 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	POP2	P39008	433 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	AIM23	P47015	356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YGR015C	P53208	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	RNH201	P53942	307 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	SLT2	Q00772	484 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	TRM82	Q03774	444 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RAI1	YGL246C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76

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