RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAP3K7	O43318	606 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MARK3	P27448	753 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PSMD7	P51665	324 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLRC3	Q07444	240 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MPP2	Q14168	576 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MTFR1	Q15390	333 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPS6KA1	Q15418	735 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SATL1	Q86VE3	508 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GDAP1	Q8TB36	358 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GAB3	Q8WWW8	586 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANKS1A	Q92625	1134 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TAF4B	Q92750	862 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CUEDC2	Q9H467	287 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPTOR	Q8N122	1335 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYH6	P13533	1939 aa		9.4	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IFNAR1	P17181	557 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GNAT2	P19087	354 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP11	P51784	963 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TREML1	Q86YW5	311 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LY9	Q9HBG7	655 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		9.4	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM196B	A6NMK8	535 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BTBD19	C9JJ37	291 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC188	H7C350	402 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PSMG1	O95456	288 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COL6A2	P12110	1019 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HAL	P42357	657 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ITGA7	Q13683	1181 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VWA3B	Q502W6	1294 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NME8	Q8N427	588 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	METTL13	Q8N6R0	699 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WASF1	Q92558	559 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SNX27	Q96L92	541 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BTBD7	Q9P203	1132 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CROT	Q9UKG9	612 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NR2E1	Q9Y466	385 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PSMA7	O14818	248 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLRC4	O43908	158 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TLR2	O60603	784 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRT38	O76015	456 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NFKBIA	P25963	317 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GTF2H1	P32780	548 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF174	Q15697	407 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IL17A	Q16552	155 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDXDC1	Q6P996	788 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLHL35	Q6PF15	583 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		9.39	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		9.39	□□□□□ -0.91

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