RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598086.5

FCHO1-224, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-224	ENST00000598086	KSR1	Q8IVT5	923 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	EFHB	Q8N7U6	833 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	WASF1	Q92558	559 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	TNFRSF25	Q93038	417 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	TLR9	Q9NR96	1032 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	CD207	Q9UJ71	328 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	FAM50B	Q9Y247	325 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	TRIO	O75962	3097 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	PER2	O15055	1255 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	TBX3	O15119	743 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	HOXA2	O43364	376 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	MARCH6	O60337	910 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	LAG3	P18627	525 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	KRT2	P35908	639 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	NEK4	P51957	841 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	FOSB	P53539	338 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	UBE3A	Q05086	875 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	ABI1	Q8IZP0	508 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	NLRP4	Q96MN2	994 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	RGL1	Q9NZL6	768 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	CLEC1B	Q9P126	229 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	CDC42EP1	Q00587	391 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	ST3GAL1	Q11201	340 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	EPHA7	Q15375	998 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF410	Q86VK4	478 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	LRRC43	Q8N309	656 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	DYDC2	Q96IM9	177 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	CEP170P1	Q96L14	293 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	LXN	Q9BS40	222 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	TLE6	Q9H808	572 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	DACT1	Q9NYF0	836 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	BTBD18	B2RXH4	712 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	WNT7A	O00755	349 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	FSCN2	O14926	492 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	ZBTB39	O15060	712 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	EOMES	O95936	686 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	PHKA2	P46019	1235 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	PLCB3	Q01970	1234 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	CYP4A11	Q02928	519 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	LONRF3	Q496Y0	759 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	LPP	Q93052	612 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	TMEM143	Q96AN5	459 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF558	Q96NG5	402 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	CHST12	Q9NRB3	414 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-224	ENST00000598086	GPR37L1	O60883	481 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	EYA4	O95677	639 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	DUSP6	Q16828	381 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	C4orf19	Q8IY42	314 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	TCF25	Q9BQ70	676 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	SPG21	Q9NZD8	308 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	LZTS1	Q9Y250	596 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		15.13	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	HIDE1	A8MVS5	230 aa		15.13	■□□□□ 0.01
FCHO1-224	ENST00000598086	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms