RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PADI3Q9ULW8 664 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PQ27 194 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PQ64 194 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PQD8 194 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAIAP3O94812 1187 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPSQ13938 189 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 E2F4Q16254 413 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPBP1Q86WP2 473 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQUBQ8NA54 791 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 DRC1Q96MC2 740 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 CUEDC2Q9H467 287 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PPC1 479 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR182O15218 404 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIP1RO75146 1068 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 IKBKEQ14164 716 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARSHQ5FYA8 562 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNH3Q9ULD8 1083 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFCAB14O75071 495 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCTN1Q2MV58 587 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 SV2BQ7L1I2 683 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM228AQ86W67 206 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 MICAL3Q7RTP6 2002 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHKA2P46019 1235 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP2R5AQ15172 486 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAW1Q8N136 415 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHX58Q96C10 678 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFT74Q96LB3 600 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFKBIZQ9BYH8 718 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLD4Q9HCU8 107 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK-5Q9HDB9 667 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYH11P35749 1972 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PFKFB1P16118 471 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTENP60484 403 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPK7Q13164 816 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASIP1Q5U651 963 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 FTHL17Q9BXU8 183 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf75Q9HAS0 396 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 ODF2LQ9ULJ1 636 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GVL5 298 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAMPTP43490 491 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPSEQ9Y251 543 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 BSNDQ8WZ55 320 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRIQ4A6NIV6 560 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBBXA8MT70 800 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 REEP2Q9BRK0 252 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT18P05783 430 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNMDQ9H2S6 317 aa36.62■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEF1Q9HAY2 307 aa36.62■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa36.61■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIT2Q14161 759 aa36.61■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FSIP1Q8NA03 581 aa36.61■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 MINDY3Q9H8M7 445 aa36.61■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 KBTBD4Q9NVX7 518 aa36.61■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP36.6■■■■□ 3.456e-11■■■■■ 51.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPRNQ4KMQ1 711 aa36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf40Q9H1Z8 148 aa36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMX1Q9H3N1 280 aa36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYMKA6NI61 221 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGFR4P22455 802 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEX3P56589 373 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR5P61964 334 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX12PQ92771 950 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC27Q9C0I9 530 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNG1Q9UIX4 513 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLS3P13797 630 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYKP43405 635 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNJ6P48051 423 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA8P51970 172 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CATSPER4Q7RTX7 472 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEPTORQ8TB45 409 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFI1A8K8P3 1242 aa36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPTX2P47972 431 aa36.58■■■■□ 3.45
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