RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		24.34	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	MCM7	P33993	719 aa		24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	EMC2	Q15006	297 aa		24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	XKR9	Q5GH70	373 aa		24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	IL27	Q8NEV9	243 aa		24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM143	Q96AN5	459 aa		24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	HCST	Q9UBK5	93 aa		24.33	■■□□□ 1.49
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf42	Q9H799	3197 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP2B1	P20020	1258 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	NLRP4	Q96MN2	994 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CASD1	Q96PB1	797 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CWH43	Q9H720	699 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	DACT1	Q9NYF0	836 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEM	A6NI47	508 aa		24.31	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF10A	O00220	468 aa		24.31	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXA2	O43364	376 aa		24.31	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		24.31	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	24.31	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	ST18	O60284	1047 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	EOMES	O95936	686 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNA5	P22460	613 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	24.3	■■□□□ 1.48	5e-8	■■■□□ 19.2
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC10	P48553	1259 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF174	Q15697	407 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	FERMT3	Q86UX7	667 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TCP11	Q8WWU5	503 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	ASAP2	O43150	1006 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	PHKA2	P46019	1235 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	RARRES1	P49788	294 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	POF1B	Q8WVV4	589 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TMX3	Q96JJ7	454 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	MTR	Q99707	1265 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	AAAS	Q9NRG9	546 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52Z1	P0C646	297 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	IRS1	P35568	1242 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	HYAL1	Q12794	435 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC38	Q5R3I4	469 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	NCK2	O43639	380 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF623	O75123	536 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	DGAT1	O75907	488 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	LTBR	P36941	435 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE3A	Q05086	875 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC43	Q8N309	656 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF169	Q8NCN4	708 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		24.27	■■□□□ 1.48
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WWV3	80 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	MED24	O75448	989 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF18	O76093	207 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	LAG3	P18627	525 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	TEC	P42680	631 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	NBR1	Q14596	966 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	ABI1	Q8IZP0	508 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF149	Q8NC42	400 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	CSPG5	O95196	566 aa		24.25	■■□□□ 1.47

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