RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 CSPG5O95196 566 aa16.52■□□□□ 0.24
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RABGGTA-211ENST00000559850 STAG3L1P0CL83 205 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 SYT1P21579 422 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 RPA1P27694 616 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 CTNNB1P35222 781 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 LONRF3Q496Y0 759 aa16.52■□□□□ 0.24
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RABGGTA-211ENST00000559850 DTHD1Q6ZMT9 781 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 RNF149Q8NC42 400 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 TCP11Q8WWU5 503 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 NACC1Q96RE7 527 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
RABGGTA-211ENST00000559850 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.52■□□□□ 0.24
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RABGGTA-211ENST00000559850 GLRA2P23416 452 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 CAPSQ13938 189 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 CATSPER4Q7RTX7 472 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 EXOC8Q8IYI6 725 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF710Q8N1W2 664 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 SNX21Q969T3 373 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 RNF19AQ9NV58 838 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 ARHGEF35A5YM69 484 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 E9PMD0 336 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 LAD1O00515 517 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 ARL2P36404 184 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 PRPHP41219 470 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM189BP81408 668 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 CDC42EP1Q00587 391 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 RESTQ13127 1097 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 GPM6BQ13491 265 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 PDIA5Q14554 519 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 PADI6Q6TGC4 694 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 HSCBQ8IWL3 235 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
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RABGGTA-211ENST00000559850 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 PLIN2Q99541 437 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
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RABGGTA-211ENST00000559850 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
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RABGGTA-211ENST00000559850 GRIN1Q05586 938 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNK18Q7Z418 384 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 BRAPQ7Z569 592 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 BSNDQ8WZ55 320 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 LPPQ93052 612 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 RAB34Q9BZG1 259 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 MTMR6Q9Y217 621 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 ASAP2O43150 1006 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 BMPR1AP36894 532 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 PHKA2P46019 1235 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 KRT79Q5XKE5 535 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 CPB2Q96IY4 423 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 SAMD11Q96NU1 681 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 PNMA5Q96PV4 448 aa16.48■□□□□ 0.23
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RABGGTA-211ENST00000559850 CLIC4Q9Y696 253 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 H3BNC9 293 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 GRM6O15303 877 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 CYP11B2P19099 503 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 PTENP60484 403 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 TFDP1Q14186 410 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTA-211ENST00000559850 HELQQ8TDG4 1101 aa16.47■□□□□ 0.23
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