RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 DGKHQ86XP1 1220 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CHST13Q8NET6 341 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 E7EVH7 732 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 RAB30Q15771 203 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA1Q5VX52 437 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 EHD2Q9NZN4 543 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TSKSQ9UJT2 592 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PSMD14O00487 310 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RNF34Q969K3 372 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 PDP2Q9P2J9 529 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CAPN9O14815 690 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GAP43P17677 238 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GRK2P25098 689 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 COG2Q14746 738 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM60Q495X7 471 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TTC38Q5R3I4 469 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 STK39Q9UEW8 545 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP73A6NFT4 308 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 E7ENQ6 273 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TTI1O43156 1089 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PDHA1P08559 390 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 LIG4P49917 911 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 XKR9Q5GH70 373 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 CXCL11O14625 94 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 BBS5Q8N3I7 341 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 HVCN1Q96D96 273 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NEK8Q86SG6 692 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GIPC2Q8TF65 315 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RABGGTAQ92696 567 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PGBD4Q96DM1 585 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 B3GALT6Q96L58 329 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CSRNP2Q9H175 543 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CUEDC2Q9H467 287 aa6.74□□□□□ -1.33
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