RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PXMP2Q9NR77 195 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 OR52Z1P0C646 297 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 E2F4Q16254 413 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPN21Q16825 1174 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 TTC3P53804 2025 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A087X0B3 334 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 BECN2A8MW95 431 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 IKBKBO14920 756 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 NEMFO60524 1076 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 GGPS1O95749 300 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 GNAT1P11488 350 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAJB1P25685 340 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 NRIP1P48552 1158 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 AP3B2Q13367 1082 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SMTNL1A8MU46 457 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 AP5Z1O43299 807 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SORBS3O60504 671 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 RGS20O76081 388 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SMC2O95347 1197 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 GLP2RO95838 553 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 ITGB1P05556 798 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 LETM2Q2VYF4 491 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PDILTQ8N807 584 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SMARCE1Q969G3 411 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 DHX58Q96C10 678 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM260Q9NX78 707 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 DMDP11532 3685 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 ENPP3O14638 875 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 DGKIO75912 1065 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 TGFB3P10600 412 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SEMA3FQ13275 785 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SUSD6Q92537 303 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SP2Q02086 613 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 MLKLQ8NB16 471 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PAGE5Q96GU1 130 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 MTMR9Q96QG7 549 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 CUEDC2Q9H467 287 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SETD4Q9NVD3 440 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 DACH1Q9UI36 760 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 EDIL3O43854 480 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 LGALS2P05162 132 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CDC25BP30305 580 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 USP11P51784 963 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 MORC3Q14149 939 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 POF1BQ8WVV4 589 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 GSDMAQ96QA5 445 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 BIN1O00499 593 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CHRNA1P02708 482 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 MYL1P05976 194 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TPM3P06753 285 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.142e-6■■□□□ 14.5
CTDSP2-204ENST00000548823 TPM4P67936 248 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 ESPNB1AK53 854 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CFBP00751 764 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 PRR29P0C7W0 189 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 GHRP10912 638 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP3A7P24462 503 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 UBA7P41226 1012 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF75DP51815 510 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 ADAM17P78536 824 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 DPYDQ12882 1025 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 PDIA5Q14554 519 aa22.18■■□□□ 1.14
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