RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-208ENST00000522907 TLK2Q86UE8 772 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 KAT2BQ92831 832 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 GJA10Q969M2 543 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 MTMR9Q96QG7 549 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 MDFIQ99750 246 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 VAV3Q9UKW4 847 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 GRIN2DO15399 1336 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 NFASCO94856 1347 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ARID2Q68CP9 1835 aa6.13□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 B4DLN1 442 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 HAS3O00219 553 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 MAFGO15525 162 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 STX6O43752 255 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 MSCO60682 206 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 STBD1O95210 358 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 BRD1O95696 1058 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 GGPS1O95749 300 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 GH1P01241 217 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 RARBP10826 455 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 HOXC8P31273 242 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 CHRNA4P43681 627 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 TRAPPC10P48553 1259 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 RGS19P49795 217 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 BEX3Q00994 111 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 MTMR1Q13613 665 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 SNX17Q15036 470 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 PTPAQ15257 358 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 KCNA10Q16322 511 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 IL17AQ16552 155 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 PRR16Q569H4 304 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 METTL7BQ6UX53 244 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 FERMT3Q86UX7 667 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ELOA3Q8NG57 546 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 PPTC7Q8NI37 304 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 STK32AQ8WU08 396 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 AFG1LQ8WV93 481 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 TRIM11Q96F44 468 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 UIMC1Q96RL1 719 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 GPR20Q99678 358 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 KIF3AQ9Y496 699 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 KAT6AQ92794 2004 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 SIP14410 1827 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 LTBP2Q14767 1821 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 A0A1W2PQY0 241 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 DNM1LO00429 736 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 TBX3O15119 743 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 F2P00734 622 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ASGR1P07306 291 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 MMP3P08254 477 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 CAPN2P17655 700 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 PDCP20941 246 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 CNGA1P29973 690 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 WEE1P30291 646 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 CDK7P50613 346 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ACLYP53396 1101 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 SOX10P56693 466 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 PPP2R5CQ13362 524 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 TRIM29Q14134 588 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 NEDD9Q14511 834 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 LETM2Q2VYF4 491 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 GNPTABQ3T906 1256 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 TTC38Q5R3I4 469 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.11□□□□□ -1.43
MSRA-208ENST00000522907 BRAPQ7Z569 592 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms