RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522018.1

TERF1-208, Transcript of telomeric repeat binding factor 1, human

TSL 3

Gene TERF1, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TERF1-208	ENST00000522018	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	GAREM2	Q75VX8	874 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018		A0A0G2JNJ9	132 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018		A0A1W2PRX2	142 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	FAM20B	O75063	409 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	SOD2	P04179	222 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	JMJD7	P0C870	316 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	MAN2A2	P49641	1150 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	WDR48	Q8TAF3	677 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	MIEF2	Q96C03	454 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	WNK4	Q96J92	1243 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	MTFR1L	Q9H019	292 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018		Q9UFV3	132 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TERF1-208	ENST00000522018	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018		B4E1Z4	1266 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	TRAF5	O00463	557 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	KCNA6	P17658	529 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	NAT1	P18440	290 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	CD38	P28907	300 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	CD83	Q01151	205 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	STIL	Q15468	1287 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	COLEC12	Q5KU26	742 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	MCM8	Q9UJA3	840 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	NPTXR	O95502	500 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	CDK4	P11802	303 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	ITGB6	P18564	788 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	NEK4	P51957	841 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	DHCR24	Q15392	516 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	CFAP100	Q494V2	611 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	AHI1	Q8N157	1196 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	ALG1	Q9BT22	464 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	IPPK	Q9H8X2	491 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	WNT9A	O14904	365 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	EYA4	O95677	639 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	PDGFRB	P09619	1106 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	FLT3	P36888	993 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	STAT5B	P51692	787 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	EVA1C	P58658	441 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	STRN3	Q13033	797 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	PAK1	Q13153	545 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	PTPA	Q15257	358 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	SYNE4	Q8N205	404 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	RABGGTA	Q92696	567 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	LENG9	Q96B70	501 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	MLST8	Q9BVC4	326 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	GPR87	Q9BY21	358 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	CBX4	O00257	560 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	AOAH	P28039	575 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	MC4R	P32245	332 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	ECE1	P42892	770 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	MOGS	Q13724	837 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TERF1-208	ENST00000522018	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58

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