RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 IFT74Q96LB3 600 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 FIZ1Q96SL8 496 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 THAP9Q9H5L6 903 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 UBE4BO95155 1302 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 MCM3APO60318 1980 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC169A6NNP5 214 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 H0YCG3 227 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 K7ENM7 598 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 PDXKO00764 312 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CBFA2T2O43439 604 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ADCY3O60266 1144 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 SCP2P22307 547 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CNGA1P29973 690 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ARL2P36404 184 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 PEX3P56589 373 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 PPP2R5AQ15172 486 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 RAET1EQ8TD07 263 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 TCP11Q8WWU5 503 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 STRA6Q9BX79 667 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 IFNKQ9P0W0 207 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 KCNJ18B7U540 433 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 MAGEB2O15479 319 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 SEPT4O43236 478 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 KPNA6O60684 536 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 HMGCRP04035 888 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 TPM3P06753 285 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF286BP0CG31 522 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 INSRRP14616 1297 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ELNP15502 786 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ABCD1P33897 745 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 HOXD13P35453 343 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 NPTX2P47972 431 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 DNM2P50570 870 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 NCKAP1LP55160 1127 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 SOX10P56693 466 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 UBASH3AP57075 661 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 GTF2BQ00403 316 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 KCNJ12Q14500 433 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 IER5Q5VY09 327 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM143Q96AN5 459 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 HVCN1Q96D96 273 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CEP63Q96MT8 703 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 ACCSQ96QU6 501 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM206Q9H813 350 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 SPC25Q9HBM1 224 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 COL1A2P08123 1366 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.47□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.47□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 SLC16A4O15374 487 aa11.47□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 RARBP10826 455 aa11.47□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CDC25BP30305 580 aa11.47□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 GJA9P57773 515 aa11.47□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 TRIM32Q13049 653 aa11.47□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TRPS1-210ENST00000519815 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms