RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 IFT122Q9HBG6 1241 aa19.87■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 RGS18Q9NS28 235 aa19.87■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 ARID2Q68CP9 1835 aa19.87■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 FGFR4P22455 802 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 SARSP49591 514 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 POU5F1BQ06416 359 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 SLC24A5Q71RS6 500 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 NPAS4Q8IUM7 802 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PNMA5Q96PV4 448 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PLIN2Q99541 437 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 CSRNP2Q9H175 543 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 CHST12Q9NRB3 414 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 DACT1Q9NYF0 836 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa19.86■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 MGEA5O60502 916 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 GLRA2P23416 452 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 TXLNAP40222 546 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PTENP60484 403 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 GRIN1Q05586 938 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 GRB10Q13322 594 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PKP1Q13835 747 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 DSC3Q14574 896 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 ATL3Q6DD88 541 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 ASAP3Q8TDY4 903 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 KIFAP3Q92845 792 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 GPRC5CQ9NQ84 441 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 MTMR10Q9NXD2 777 aa19.85■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 SPTLC2O15270 562 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 CAPSQ13938 189 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PPP2R5AQ15172 486 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM119Q4V9L6 283 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 KCNK18Q7Z418 384 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 LINC00301Q8NCQ3 95 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 IFT74Q96LB3 600 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 CCSER1Q9C0I3 900 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC39Q9UFE4 941 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 CFAP45Q9UL16 551 aa19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 LCHNA4D1U4 455 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 LRRIQ4A6NIV6 560 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 C9IYK1 514 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 ERLIN2O94905 339 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 YEATS4O95619 227 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 BRD1O95696 1058 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PLA2G4BP0C869 781 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 SPECC1Q5M775 1068 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 RINT1Q6NUQ1 792 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 CLIC6Q96NY7 704 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 TIPINQ9BVW5 301 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 NFKBIZQ9BYH8 718 aa19.83■□□□□ 0.77
FAAP20-215ENST00000514625 PPP6R2O75170 966 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 FAM189BP81408 668 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 TAP1Q03518 808 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 GRIN2CQ14957 1233 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 KARSQ15046 597 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 EPSTI1Q96J88 318 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 DRC1Q96MC2 740 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 C2orf40Q9H1Z8 148 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 MINDY3Q9H8M7 445 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM161AQ9NX61 479 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 KCND2Q9NZV8 630 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 PTPRSQ13332 1948 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 GBF1Q92538 1859 aa19.82■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 LINC01553A4QN01 128 aa19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 DGKIO75912 1065 aa19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 SKIP12755 728 aa19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 PLCG1P19174 1290 aa19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 NAMPTP43490 491 aa19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 C1orf186Q6ZWK4 172 aa19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 FIBCD1Q8N539 461 aa19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 DEPTORQ8TB45 409 aa19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
FAAP20-215ENST00000514625 RUSC1Q9BVN2 902 aa19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms