RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510920.5

FAM200B-217, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-217	ENST00000510920	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.66	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.66	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.66	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.66	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		13.66	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.66	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	ASAP2	O43150	1006 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	MGEA5	O60502	916 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	MUT	P22033	750 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	REST	Q13127	1097 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	TFDP1	Q14186	410 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FAM200B-217	ENST00000510920	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	CDC25A	P30304	524 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	PHKA2	P46019	1235 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	IL17A	Q16552	155 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	RFXAP	O00287	272 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	ECM1	Q16610	540 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920		C9IYK1	514 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920		E9PMD0	336 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	MAP3K13	O43283	966 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	DGKI	O75912	1065 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	ERLIN2	O94905	339 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	CTNNB1	P35222	781 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	ERVK-21	P61565	698 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	CAPS	Q13938	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	DSC3	Q14574	896 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	PLIN2	Q99541	437 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	TTC3	P53804	2025 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	HOXA2	O43364	376 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	EYA4	O95677	639 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	CYP11B2	P19099	503 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	GLRA2	P23416	452 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	ARL2	P36404	184 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	UBA7	P41226	1012 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM200B-217	ENST00000510920	GATM	P50440	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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