RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCP11Q8WWU5 503 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPME1Q9Y570 386 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIAA1671Q9BY89 1806 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PP2D1A8MPX8 630 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDIT3P35638 169 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RARRES1P49788 294 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPM6BQ13491 265 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IL17AQ16552 155 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ECM1Q16610 540 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LONRF3Q496Y0 759 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FERMT3Q86UX7 667 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SAMD11Q96NU1 681 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IFT122Q9HBG6 1241 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRWD1Q9UFC0 647 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MTMR6Q9Y217 621 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 REV3LO60673 3130 aa13.47□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGEF35A5YM69 484 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GAS2O43903 313 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DGAT1O75907 488 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LINC00271P0C7V0 271 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPA1P27694 616 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDC25AP30304 524 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BMPR1AP36894 532 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM189BP81408 668 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RILPL1Q5EBL4 403 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DTHD1Q6ZMT9 781 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ECHDC2Q86YB7 292 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RNF149Q8NC42 400 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ASAP3Q8TDY4 903 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NACC1Q96RE7 527 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPRC5CQ9NQ84 441 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM161AQ9NX61 479 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HCSTQ9UBK5 93 aa13.46□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRANK1O15050 2925 aa13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 H3BNC9 293 aa13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STX6O43752 255 aa13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HAUS3Q68CZ6 603 aa13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAB34Q9BZG1 259 aa13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POLD4Q9HCU8 107 aa13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIAA1024Q9UPX6 916 aa13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VWA3AA6NCI4 1184 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LAD1O00515 517 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GRM6O15303 877 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ASAP2O43150 1006 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GLRA2P23416 452 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARL2P36404 184 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRPHP41219 470 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PHKA2P46019 1235 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RESTQ13127 1097 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CAPSQ13938 189 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PADI6Q6TGC4 694 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABI1Q8IZP0 508 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGSF22Q8N9C0 903 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HELQQ8TDG4 1101 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LPPQ93052 612 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CHST12Q9NRB3 414 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RNF19AQ9NV58 838 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DACT1Q9NYF0 836 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RWDD3Q9Y3V2 267 aa13.44□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 A0A0U1RQF3 1178 aa13.43□□□□□ -0.26
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRRIQ4A6NIV6 560 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms