RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 HUNKP57058 714 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 FANCCQ00597 558 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYL5Q02045 173 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPIL2Q13356 520 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNAPC2Q13487 334 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPN14Q15678 1187 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF43Q68DV7 783 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCTP2Q6DN12 878 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 MOB2Q70IA6 237 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CNNM3Q8NE01 707 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CUL5Q93034 780 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 COA7Q96BR5 231 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 OPTNQ96CV9 577 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHRDQ9H2X0 955 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPVLQ9H3G5 476 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 BARHL2Q9NY43 387 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 DOCK1Q14185 1865 aa6.26□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP27XA6NNY8 438 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 GSC2O15499 205 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYTH3O43739 400 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERPINC1P01008 464 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CETPP11597 493 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADCY7P51828 1080 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 GTF2A2P52657 109 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PNOCQ13519 176 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PKN1Q16512 942 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC174Q6PII3 467 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 BLIDQ8IZY5 108 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHISA5Q8N114 240 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 C12orf42Q96LP6 360 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP41Q9BYV8 373 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 BTBD18B2RXH4 712 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 H3BRJ5 948 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 STXBP3O00186 592 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 MARCH6O60337 910 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 VCAM1P19320 739 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP2B1P20020 1258 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 INHBEP58166 350 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNAP25P60880 206 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 FSTL1Q12841 308 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLS1Q14651 629 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 USH1GQ495M9 461 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 LONRF3Q496Y0 759 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CST9Q5W186 159 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 ISM2Q6H9L7 571 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 RGMBQ6NW40 437 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 DTX1Q86Y01 620 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPXCR1Q8N123 301 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.24□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 MLKLQ8NB16 471 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms