RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	LDHD	Q86WU2	507 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	IQCA1	Q86XH1	822 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	7.12	□□□□□ -1.27	9e-34	■□□□□ 10.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM13C	Q8NE31	585 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX11	Q96FC9	970 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	WRNIP1	Q96S55	665 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXQ1	Q9C009	403 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	STX8	Q9UNK0	236 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PASK	Q96RG2	1323 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC69	A6NI79	296 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266		F5H6K3	240 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACR	P10323	421 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNAR1	P17181	557 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GUCY2C	P25092	1073 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GJB2	P29033	226 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC16A2	P36021	539 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	RCAN1	P53805	252 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAP25	P60880	206 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLRC3	Q07444	240 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF543	Q08ER8	600 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	BECN1	Q14457	450 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPY5R	Q15761	445 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCTD1	Q719H9	257 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMTC2	Q8N394	836 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GATA6	Q92908	595 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KAT14	Q9H8E8	782 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLHL3	Q9UH77	587 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTMR6	Q9Y217	621 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PEX10	O60683	326 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PROC	P04070	461 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYT1	P21579	422 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NT5C2	P49902	561 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPP2	Q13103	211 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARSH	Q5FYA8	562 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCAF15	Q66K64	600 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLFN13	Q68D06	897 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTMR8	Q96EF0	704 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNK4	Q96J92	1243 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K14	Q99558	947 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	VCPKMT	Q9H867	229 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAX	Q9Y2V3	346 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCN4A	P35499	1836 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PQH9	124 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERICH2	A1L162	156 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF28P	B7ZC32	967 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLRF2	D3W0D1	207 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	RGS13	O14921	159 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	EDIL3	O43854	480 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASNS	P08243	561 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCNF	P41002	786 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GUCY1B3	Q02153	619 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERINC3	Q13530	473 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		7.09	□□□□□ -1.27

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