RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489527.1

GTPBP1-213, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-213	ENST00000489527	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	RAD9A	Q99638	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	MTR	Q99707	1265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	GINS2	Q9Y248	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	TRANK1	O15050	2925 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	GBF1	Q92538	1859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527		H0YCG3	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	STX6	O43752	255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	LYPLA2	O95372	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCNE2	O96020	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	F13A1	P00488	732 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CTSH	P09668	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	SCP2	P22307	547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PTGS1	P23219	599 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	AXL	P30530	894 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PRPH	P41219	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	TEC	P42680	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	FOSB	P53539	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	KRT85	P78386	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PRKCE	Q02156	737 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZNF174	Q15697	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	GJD3	Q8N144	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	BANK1	Q8NDB2	785 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	OXER1	Q8TDS5	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	LENG9	Q96B70	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	AK8	Q96MA6	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	PCYT2	Q99447	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	LXN	Q9BS40	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-213	ENST00000489527	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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