RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 FAM184BQ9ULE4 1060 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 TBX20Q9UMR3 447 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF286BP0CG31 522 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 FLT3LGP49771 235 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 C16orf70Q9BSU1 422 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 KCNF1Q9H3M0 494 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 GABRQQ9UN88 632 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 ITIH6Q6UXX5 1313 aa29.43■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 ARID5BQ14865 1188 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 CEP135Q66GS9 1140 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 TCP11Q8WWU5 503 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 NDST4Q9H3R1 872 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PQC6 194 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 ESPNB1AK53 854 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 H3BRB1 525 aa29.41■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 SCP2P22307 547 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 GLRA2P23416 452 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 VEGFBP49765 207 aa29.41■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 TLK2Q86UE8 772 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 ASAP3Q8TDY4 903 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 RNF186Q9NXI6 227 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 PPFIBP1Q86W92 1011 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 MAP4K3Q8IVH8 894 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 SUGCTQ9HAC7 445 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 TRIM59Q8IWR1 403 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 DEPTORQ8TB45 409 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa29.39■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 AKAP3O75969 853 aa29.39■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 LRMPQ12912 555 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 ARMCX5Q6P1M9 558 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB3-210ENST00000489475 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29.39■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 Q9Y3F1 56 aa29.39■■■□□ 2.3
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HOXB3-210ENST00000489475 C22orf31O95567 290 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-210ENST00000489475 RBL2Q08999 1139 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-210ENST00000489475 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-210ENST00000489475 CAPSQ13938 189 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-210ENST00000489475 SYCP1Q15431 976 aa29.35■■■□□ 2.29
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