RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	FERMT3	Q86UX7	667 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	DGAT1	O75907	488 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	32.61	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM189B	P81408	668 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	NACC1	Q96RE7	527 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	LAD1	O00515	517 aa		32.6	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	FGFR1	P11362	822 aa		32.6	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	GPM6B	Q13491	265 aa		32.6	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	ECM1	Q16610	540 aa		32.6	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		32.6	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	RNF149	Q8NC42	400 aa		32.6	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	PP2D1	A8MPX8	630 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	PRPH	P41219	470 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	PDIA5	Q14554	519 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	ASAP2	O43150	1006 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	BMPR1A	P36894	532 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	RNF169	Q8NCN4	708 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	RAB34	Q9BZG1	259 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
FBXO18-208	ENST00000470089		H3BNC9	293 aa		32.57	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	CDC25A	P30304	524 aa		32.57	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		32.57	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		32.57	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		32.57	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	PDC	P20941	246 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	ARL2	P36404	184 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	CHST12	Q9NRB3	414 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	RNF19A	Q9NV58	838 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	DACT1	Q9NYF0	836 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	MUT	P22033	750 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	PHKA2	P46019	1235 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	CAPS	Q13938	189 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	BRAP	Q7Z569	592 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	HCST	Q9UBK5	93 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A0U1RQF3	1178 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	GLRA2	P23416	452 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	TFDP1	Q14186	410 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	PADI6	Q6TGC4	694 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	RB1	P06400	928 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	SYT1	P21579	422 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	PTEN	P60484	403 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	KRT79	Q5XKE5	535 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	SNX21	Q969T3	373 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	STK24	Q9Y6E0	443 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A0C4DFX4	3053 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	LONRF3	Q496Y0	759 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FBXO18-208	ENST00000470089	CASD1	Q96PB1	797 aa		32.51	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		32.51	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	GRM6	O15303	877 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	HOXA2	O43364	376 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	CSPG5	O95196	566 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	PTPRO	Q16827	1216 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	ABI1	Q8IZP0	508 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	LPP	Q93052	612 aa		32.5	■■■□□ 2.79

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