RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 MYH11P35749 1972 aa22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 DGKIO75912 1065 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 BMP15O95972 392 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 MUTP22033 750 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 CTNNB1P35222 781 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 ABI1Q8IZP0 508 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 RNF149Q8NC42 400 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.79■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 CDH23Q9H251 3354 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 COL4A6Q14031 1691 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 ERLIN2O94905 339 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SYT1P21579 422 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 ADGRE1Q14246 886 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SPRED2Q7Z698 418 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM192Q8IY95 271 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.78■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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SCAF8-204ENST00000461219 C9IYK1 514 aa22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 HOXA2O43364 376 aa22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 GRB10Q13322 594 aa22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 EPC2Q52LR7 807 aa22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 PADI6Q6TGC4 694 aa22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 CHST12Q9NRB3 414 aa22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.77■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 DSC3Q14574 896 aa22.76■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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SCAF8-204ENST00000461219 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.76■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.76■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 DNM3Q9UQ16 869 aa22.76■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 COL6A3P12111 3177 aa22.75■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.75■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 PP2D1A8MPX8 630 aa22.75■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.75■■□□□ 1.23
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SCAF8-204ENST00000461219 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.75■■□□□ 1.23
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SCAF8-204ENST00000461219 GATMP50440 423 aa22.74■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.74■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.74■■□□□ 1.23
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SCAF8-204ENST00000461219 FGFR1P11362 822 aa22.73■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 ARL2P36404 184 aa22.73■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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SCAF8-204ENST00000461219 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.73■■□□□ 1.23
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SCAF8-204ENST00000461219 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.73■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 IFT74Q96LB3 600 aa22.73■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.73■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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SCAF8-204ENST00000461219 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 RB1P06400 928 aa22.72■■□□□ 1.23
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SCAF8-204ENST00000461219 UBA7P41226 1012 aa22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 RAB27AP51159 221 aa22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 PTENP60484 403 aa22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 FAM189BP81408 668 aa22.72■■□□□ 1.23
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SCAF8-204ENST00000461219 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 CALML4Q96GE6 196 aa22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.72■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 H3BNC9 293 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 EYA4O95677 639 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 CYP11B2P19099 503 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 GLRA2P23416 452 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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