RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 BCAR1P56945 870 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 KCNC3Q14003 757 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 SLC5A5Q92911 643 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 LPPQ93052 612 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 PRRX2Q99811 253 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 NR2E1Q9Y466 385 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 A0A087WZ62 844 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 TDP2O95551 362 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 CXCL14O95715 111 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 EOMESO95936 686 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 HSPA4P34932 840 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 DNM2P50570 870 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 USP11P51784 963 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 GBP3Q9H0R5 595 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 NID2Q14112 1375 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 IFNAR1P17181 557 aa21.73■■□□□ 1.07
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UBXN4-202ENST00000415164 PSMA5P28066 241 aa21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 NTRK3Q16288 839 aa21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 VPS52Q8N1B4 723 aa21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 ASIC4Q96FT7 647 aa21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 NLRP4Q96MN2 994 aa21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 POMKQ9H5K3 350 aa21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 C2CD4DB7Z1M9 353 aa21.72■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 EDIL3O43854 480 aa21.72■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 PHKA2P46019 1235 aa21.72■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 TCF15Q12870 199 aa21.72■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 XKR3Q5GH77 459 aa21.72■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.72■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 CPLX1O14810 134 aa21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 PSMD10O75832 226 aa21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 AVPR2P30518 371 aa21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 ITIH3Q06033 890 aa21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 KSR1Q8IVT5 923 aa21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 KCNB2Q92953 911 aa21.71■■□□□ 1.07
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UBXN4-202ENST00000415164 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 CHST12Q9NRB3 414 aa21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.71■■□□□ 1.07
UBXN4-202ENST00000415164 CDC42EP1Q00587 391 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 STK3Q13188 491 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 MTMR3Q13615 1198 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 Q4G0T1 1027 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 KANK3Q6NY19 840 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 RDM1Q8NG50 284 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 RIPOR3Q96MK2 946 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 EPCAMP16422 314 aa21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 MTHFRP42898 656 aa21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 BLIDQ8IZY5 108 aa21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 ZBP1Q9H171 429 aa21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.69■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 ASGR2P07307 311 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 SKIP12755 728 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF410Q86VK4 478 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 AIFM3Q96NN9 605 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN4-202ENST00000415164 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.68■■□□□ 1.06
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