RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 IPPQ9Y573 584 aa7.36□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 PTGS2P35354 604 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT20P35900 424 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CLCN4P51793 760 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 NR5A1Q13285 461 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 STK38Q15208 465 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 TRPA1O75762 1119 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF18O76093 207 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 NLRP10Q86W26 655 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT23Q9C075 422 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRRT4C9JH25 899 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 RCVRNP35243 200 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 GBP3Q9H0R5 595 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 LIMK1P53667 647 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 CATSPER2Q96P56 530 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 THAP1Q9NVV9 213 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 SENP1Q9P0U3 644 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 TMX2Q9Y320 296 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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