RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379031.9

PUSL1-201, Transcript of pseudouridylate synthase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUSL1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUSL1-201ENST00000379031 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PUSL1-201ENST00000379031 ERVFC1P60507 584 aa22.33■■□□□ 1.17
PUSL1-201ENST00000379031 EPHA7Q15375 998 aa22.33■■□□□ 1.17
PUSL1-201ENST00000379031 HELQQ8TDG4 1101 aa22.33■■□□□ 1.17
PUSL1-201ENST00000379031 TMEM143Q96AN5 459 aa22.33■■□□□ 1.17
PUSL1-201ENST00000379031 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PUSL1-201ENST00000379031 PER2O15055 1255 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 TBX3O15119 743 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 COL9A1P20849 921 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 ADAM15Q13444 863 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 GJD3Q8N144 294 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 LPPQ93052 612 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 AAASQ9NRG9 546 aa22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.31■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 NDUFV1P49821 464 aa22.31■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 CALCRLQ16602 461 aa22.31■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 ABI1Q8IZP0 508 aa22.31■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 A0A087WWV3 80 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 A0A0U1RQF3 1178 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 NCK2O43639 380 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 GLP2RO95838 553 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 LAG3P18627 525 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 ATP2B1P20020 1258 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 TRIM29Q14134 588 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 TPH2Q8IWU9 490 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 LRRC43Q8N309 656 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 TLR9Q9NR96 1032 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.3■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 HOXA2O43364 376 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 MBTPS2O43462 519 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 PHKA2P46019 1235 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 EMC2Q15006 297 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 XKR9Q5GH70 373 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 ZNF410Q86VK4 478 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 C4orf19Q8IY42 314 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 EFHBQ8N7U6 833 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 CLEC1BQ9P126 229 aa22.29■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 SLITRK3O94933 977 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 TXKP42681 527 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 ZP2Q05996 745 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 ZNF558Q96NG5 402 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 TLE6Q9H808 572 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 DACT1Q9NYF0 836 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 CD207Q9UJ71 328 aa22.28■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 FSCN2O14926 492 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 NEMFO60524 1076 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 RFC5P40937 340 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 CDC42EP1Q00587 391 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 UBE3AQ05086 875 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 CHST12Q9NRB3 414 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.27■■□□□ 1.16
PUSL1-201ENST00000379031 HIDE1A8MVS5 230 aa22.26■■□□□ 1.15
PUSL1-201ENST00000379031 EOMESO95936 686 aa22.26■■□□□ 1.15
PUSL1-201ENST00000379031 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PUSL1-201ENST00000379031 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PUSL1-201ENST00000379031 C8orf34Q49A92 452 aa22.26■■□□□ 1.15
PUSL1-201ENST00000379031 KIF2CQ99661 725 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms