RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 MMP1P03956 469 aa8.74□□□□□ -1.01
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PKHD1-201ENST00000340994 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.74□□□□□ -1.01
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PKHD1-201ENST00000340994 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
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PKHD1-201ENST00000340994 TRIM49CP0CI26 452 aa8.73□□□□□ -1.01
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PKHD1-201ENST00000340994 GFPT2O94808 682 aa8.73□□□□□ -1.01
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PKHD1-201ENST00000340994 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.73□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.73□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.73□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PRDM1O75626 825 aa8.73□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 RALBP11234 206 aa8.73□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SP4Q02446 784 aa8.72□□□□□ -1.01
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PKHD1-201ENST00000340994 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 MAP4K1Q92918 833 aa8.72□□□□□ -1.01
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