RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 ENC1O14682 589 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 PEX10O60683 326 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 ICAM3P32942 547 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 SMTNP53814 917 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 STXBP2Q15833 593 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 ANO5Q75V66 913 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 OPTNQ96CV9 577 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 OGFRQ9NZT2 677 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 PRLRP16471 622 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 FERP16591 822 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 RFX1P22670 979 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 PEX3P56589 373 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 MYL7Q01449 175 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 NOX5Q96PH1 765 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 TUBBP07437 444 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 NPEPPSP55786 919 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 VPS36Q86VN1 386 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM150BA6NC51 233 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 P4HA2O15460 535 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 MOCS3O95396 460 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ABCD1P33897 745 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 STAT1P42224 750 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 RTP1P59025 263 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ACTR2P61160 394 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ARID5AQ03989 594 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 IQCEQ6IPM2 695 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ILDR2Q71H61 639 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 CEP170P1Q96L14 293 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 TSKSQ9UJT2 592 aa20.14■□□□□ 0.81
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HCLS1-201ENST00000314583 SLC16A4O15374 487 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ATP8B1O43520 1251 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 DGAT1O75907 488 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 GFPT2O94808 682 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 STBD1O95210 358 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 GJA5P36382 358 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 CETN1Q12798 172 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 BRD3Q15059 726 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 A0A087X0T9 212 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF862O60290 1169 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 FAM228BP0C875 321 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 CNTN2Q02246 1040 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ARID3AQ99856 593 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 STK33Q9BYT3 514 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 SNX12Q9UMY4 172 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 MYH10P35580 1976 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC172P0C7W6 258 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM49P0CI25 452 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM49CP0CI26 452 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 VAMP7P51809 220 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 PTK2Q05397 1052 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 NAB2Q15742 525 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-201ENST00000314583 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
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