RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD65E5RJM6 399 aa23.41■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 PPP1R37O75864 691 aa23.41■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 WDR93Q6P2C0 686 aa23.41■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 SPAG5Q96R06 1193 aa23.41■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 ACAD9Q9H845 621 aa23.41■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.41■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 CLGNO14967 610 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 SRGAP2O75044 1071 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 RNF40O75150 1001 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 MOCS3O95396 460 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 SFNP31947 248 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 VGLL4Q14135 290 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 C4orf19Q8IY42 314 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 STRA6Q9BX79 667 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 NPEPPSP55786 919 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 XKR9Q5GH70 373 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 GPRASP2Q96D09 838 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.4■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 WDR90Q96KV7 1748 aa23.39■■□□□ 1.34
MESP1-201ENST00000300057 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.39■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.39■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.39■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SORBS3O60504 671 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PLS3P13797 630 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 USP8P40818 1118 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SP4Q02446 784 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 RDH13Q8NBN7 331 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 DMAC2Q9NW81 257 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 TISP43B9A030 160 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 ADM5C9JUS6 153 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 ATP2A1O14983 1001 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 EXOC3O60645 756 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 ERLIN2O94905 339 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 TRIM49P0CI25 452 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 TRIM49CP0CI26 452 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 GJB7Q6PEY0 223 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SIX2Q9NPC8 291 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.38■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PEX10O60683 326 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 TACC1O75410 805 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 RGS20O76081 388 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 TRIM58Q8NG06 486 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 CXorf56Q9H5V9 222 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SBF1O95248 1867 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 CCDC172P0C7W6 258 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 TREML2Q5T2D2 321 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.37■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 KCNA2P16389 499 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 MCM3P25205 808 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PEX3P56589 373 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 A0A087X0T9 212 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 ANO9A1A5B4 782 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SLC16A4O15374 487 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PJA2O43164 708 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SYF2O95926 243 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 FAM228BP0C875 321 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 FMO5P49326 533 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 ANO5Q75V66 913 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 ACCSQ96QU6 501 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.36■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SLC18A3Q16572 532 aa23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 MAP9Q49MG5 647 aa23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 TMEM206Q9H813 350 aa23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 RNF181Q9P0P0 153 aa23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 BUB1O43683 1085 aa23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
MESP1-201ENST00000300057 PTK2Q05397 1052 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms