RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 SCLYQ96I15 445 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 FIZ1Q96SL8 496 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 C7orf25Q9BPX7 421 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 PARVGQ9HBI0 331 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 STK24Q9Y6E0 443 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 VCANP13611 3396 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 KPNA6O60684 536 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CD44P16070 742 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SYN1P17600 705 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 HOXC8P31273 242 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 FAAP100Q0VG06 881 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 TIGD1Q96MW7 591 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CUEDC2Q9H467 287 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 K7ENM7 598 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 B4GALT5O43286 388 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 GCNT3O95395 438 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 GUCY2CP25092 1073 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CDK7P50613 346 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 AMPD3Q01432 767 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SERINC5Q86VE9 423 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 LINC01465Q8N7H1 131 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 RETREG2Q8NC44 543 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 EXOC1Q9NV70 894 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CABYRO75952 493 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CHRNA1P02708 482 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CYP2C18P33260 490 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 ARL2P36404 184 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 RTP1P59025 263 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.99□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 RFC5P40937 340 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 STX17P56962 302 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 UNC13DQ70J99 1090 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SPATA20Q8TB22 786 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SCN5AQ14524 2016 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 C5orf42Q9H799 3197 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 DENND3A2RUS2 1198 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 GPR32O75388 356 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 GHRP10912 638 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CKBP12277 381 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 PLS3P13797 630 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 TMOD1P28289 359 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 GPC3P51654 580 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 MBTPS1Q14703 1052 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 DRC1Q96MC2 740 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 MAP7D2Q96T17 732 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 GNAT1P11488 350 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 HOXD13P35453 343 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 PRCPP42785 496 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 DNM2P50570 870 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 ZNF131P52739 623 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 EHHADHQ08426 723 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SEZ6Q53EL9 994 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 KANK3Q6NY19 840 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CPB2Q96IY4 423 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 RNF19AQ9NV58 838 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 USP25Q9UHP3 1055 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 ALPK3Q96L96 1907 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 MAGEB2O15479 319 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CD4P01730 458 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 IER5Q5VY09 327 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 DEFB128Q7Z7B8 93 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms