RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRE-201ENST00000254667 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PTPRE-201ENST00000254667 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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PTPRE-201ENST00000254667 SMARCA1P28370 1054 aa20.26■□□□□ 0.83
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PTPRE-201ENST00000254667 TAP1Q03518 808 aa20.26■□□□□ 0.83
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