RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Chn1Q91V57 459 aa18.08■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CtsqQ91ZF4 343 aa18.08■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrrc38A2VDH3 298 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Krt90E9Q1Z0 538 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sem1P60897 70 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cnot7Q60809 285 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ppp2r2aQ6P1F6 447 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klra17Q9JMA4 273 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm28043E0CXC2 719 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mylk3Q3UIZ8 795 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sult1d1Q3UZZ6 295 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Epha7Q61772 998 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pak4Q8BTW9 593 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SucoQ8C341 1250 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnf112Q96DY5 654 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Krt27Q9Z320 448 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm5926E9PWJ8 236 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gucy2eP52785 1108 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TbataQ7TSD4 393 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vipas39Q8BGQ1 491 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CbsQ91WT9 561 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rpa3Q9CQ71 121 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cox16Q9CR63 106 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyth3O08967 399 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tbc1d1Q60949 1255 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ces1eQ64176 562 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8BWG4 1187 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc13a1Q9JHI4 594 aa18.07■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm9774A0A0A6YVU8 407 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psmd5Q8BJY1 504 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Abhd8Q8R0P8 439 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc5a5Q99PN0 618 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arl4aP61213 200 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nmrk1Q91W63 195 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pls3Q99K51 630 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfand4D3Z3C6 739 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01734 135 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Irx1P81068 480 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Taf1bP97358 586 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tob2Q9JM55 345 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ttc13A0A1L1SSC7 844 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm382B1AXN3 1250 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psmc5P62196 406 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 DaglaQ6WQJ1 1044 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bank1Q80VH0 783 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bbs7Q8K2G4 715 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc35g2D3YVE8 412 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpina1aP07758 413 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpina1bP22599 413 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpina1cQ00896 412 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpina1dQ00897 413 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ItkQ03526 625 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Scrn2Q8VCA8 425 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Syap1Q9D5V6 365 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmod3Q9JHJ0 352 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klhl38Q8BSF5 581 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tube1Q9D6T1 475 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tbx18Q9EPZ6 613 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc40a1Q9JHI9 570 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hebp1Q9R257 190 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plekha5E9Q6H8 1269 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fgd3O88842 733 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cst8P32766 142 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gdf10P97737 476 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc85aQ5SP85 500 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Acbd5Q5XG73 508 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Krt5Q922U2 580 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kif11Q6P9P6 1052 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 IqceQ6PCQ0 778 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rassf6Q80UQ2 353 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Anapc5Q8BTZ4 740 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cpa5Q8R4H4 436 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ankrd49Q8VE42 238 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Scrn1Q9CZC8 414 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Homer2Q9QWW1 354 aa18.05■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plcg1Q62077 1302 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arhgap42B2RQE8 841 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm1758F6VZZ1 202 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Micall2Q3TN34 1009 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P2ry10Q8BFU7 328 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sytl1Q99N80 567 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Git2Q9JLQ2 708 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prl2c1Q5SVL9 228 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 BcrQ6PAJ1 1270 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CalcbQ99MP3 130 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.5 ms