RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	GYP7	P48365	746 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	NUP145	P49687	1317 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	KCC4	P25389	1037 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	UGA3	P26370	528 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	NSE3	Q05541	303 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	RRT14	P40470	206 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	EDE1	P34216	1381 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	DOT5	P40553	215 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDR2	YOL052C-A	RAD2	P07276	1031 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDR2	YOL052C-A	ATG13	Q06628	738 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDR2	YOL052C-A	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
DDR2	YOL052C-A	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
DDR2	YOL052C-A	LYS2	P07702	1392 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDR2	YOL052C-A	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.61	□□□□□ -0.23	not detected
DDR2	YOL052C-A	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDR2	YOL052C-A	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDR2	YOL052C-A	COB	P00163	385 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDR2	YOL052C-A	SRT1	Q03175	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDR2	YOL052C-A	COQ4	O13525	335 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	YIL092W	P40497	633 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	YBP2	P53169	641 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	LAM6	Q08001	693 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	RIM15	P43565	1770 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	YBR287W	P38355	427 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	YMR074C	Q04773	145 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	DAL5	P15365	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	YKR075C	P36155	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	YOL057W	Q08225	711 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	RMT2	Q03305	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDR2	YOL052C-A	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	ALE1	Q08548	619 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	RAD4	P14736	754 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	YJL181W	P46987	611 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	YPP1	P46951	817 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	MDG1	P53885	366 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
DDR2	YOL052C-A	UBP1	P25037	809 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	POL32	P47110	350 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	DNM1	P54861	757 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	SSP2	Q08646	371 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	MSB4	Q12317	492 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	YDR306C	Q06640	478 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	MRP7	P12687	371 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	TFA1	P36100	482 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	NPR2	P39923	615 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	CSI1	Q04368	295 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	PHM7	Q12252	991 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	CST6	P40535	587 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	YJR008W	P47085	338 aa		13.4	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	ZDS2	P54786	942 aa		13.4	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
DDR2	YOL052C-A	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
DDR2	YOL052C-A	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DDR2	YOL052C-A	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DDR2	YOL052C-A	RAD24	P32641	659 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DDR2	YOL052C-A	VPS64	Q03944	604 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDR2	YOL052C-A	SWI1	P09547	1314 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDR2	YOL052C-A	NUP133	P36161	1157 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDR2	YOL052C-A	YPR204W	Q08995	1032 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDR2	YOL052C-A	BOI2	P39969	1040 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	TEA1	P47988	759 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	YGR122W	P53272	402 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	YLR271W	Q06152	274 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	NYV1	Q12255	253 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	ARG8	P18544	423 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	GTT3	P39996	337 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	SPO1	P53541	631 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	BUG1	Q12191	341 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	SWC3	P31376	625 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	BDF1	P35817	686 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DDR2	YOL052C-A	DCD1	P06773	312 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDR2	YOL052C-A	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
DDR2	YOL052C-A	PRI1	P10363	409 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDR2	YOL052C-A	UBP12	P39538	1254 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDR2	YOL052C-A	ALD2	P47771	506 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDR2	YOL052C-A	YGL082W	P53155	381 aa		13.27	□□□□□ -0.29

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