RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	SAP155	P43612	1002 aa		7.25	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	LYS2	P07702	1392 aa		7.24	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	MAM1	P40065	302 aa		7.23	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	KCC4	P25389	1037 aa		7.23	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	RTT109	Q07794	436 aa		7.23	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	COB	P00163	385 aa		7.22	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	UGA3	P26370	528 aa		7.22	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	TPD3	P31383	635 aa		7.22	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	YKR075C	P36155	307 aa		7.22	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	ATG13	Q06628	738 aa		7.22	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
AMD1	YML035C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	GYP7	P48365	746 aa		7.2	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	LAM6	Q08001	693 aa		7.2	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	NSE3	Q05541	303 aa		7.2	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	UBP1	P25037	809 aa		7.19	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.19	□□□□□ -1.26	not detected
AMD1	YML035C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	YBP2	P53169	641 aa		7.18	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	RRT14	P40470	206 aa		7.17	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	YJL181W	P46987	611 aa		7.17	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	NPR2	P39923	615 aa		7.17	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	RMT2	Q03305	412 aa		7.16	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	COQ4	O13525	335 aa		7.16	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	ALE1	Q08548	619 aa		7.15	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
AMD1	YML035C	SRT1	Q03175	343 aa		7.14	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	MDG1	P53885	366 aa		7.13	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	YOL057W	Q08225	711 aa		7.13	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	MSB4	Q12317	492 aa		7.13	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	RAD4	P14736	754 aa		7.13	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.13	□□□□□ -1.27	not detected
AMD1	YML035C	YIL092W	P40497	633 aa		7.12	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	RAD2	P07276	1031 aa		7.11	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	YBR287W	P38355	427 aa		7.11	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	SSP2	Q08646	371 aa		7.11	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	PRI1	P10363	409 aa		7.11	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	GTT3	P39996	337 aa		7.11	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	PHM7	Q12252	991 aa		7.11	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	YPP1	P46951	817 aa		7.1	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	YDR306C	Q06640	478 aa		7.1	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	BDF1	P35817	686 aa		7.09	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
AMD1	YML035C	DAL5	P15365	543 aa		7.08	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	YJR008W	P47085	338 aa		7.08	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	DNM1	P54861	757 aa		7.08	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	BUG1	Q12191	341 aa		7.08	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	MRP7	P12687	371 aa		7.08	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	CST6	P40535	587 aa		7.07	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	ALD2	P47771	506 aa		7.07	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	CTH1	P47976	325 aa		7.07	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	NYV1	Q12255	253 aa		7.07	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	SWI1	P09547	1314 aa		7.06	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	YBL086C	P38177	466 aa		7.06	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	TEA1	P47988	759 aa		7.06	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	ARG8	P18544	423 aa		7.06	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	ZDS2	P54786	942 aa		7.06	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	CSI1	Q04368	295 aa		7.05	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	YLR271W	Q06152	274 aa		7.05	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	YPR204W	Q08995	1032 aa		7.05	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	ALD3	P54114	506 aa		7.05	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	RAD24	P32641	659 aa		7.03	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	UGA2	P38067	497 aa		7.03	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	VPS64	Q03944	604 aa		7.03	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	POL32	P47110	350 aa		7.03	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	NUP133	P36161	1157 aa		7.02	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.28
AMD1	YML035C	DCD1	P06773	312 aa		7.02	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	TOS1	P38288	455 aa		7.02	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	BOI2	P39969	1040 aa		7.02	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	YGR122W	P53272	402 aa		7.01	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	YGL082W	P53155	381 aa		7.01	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29

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