RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 PTPRGP23470 1445 aa26.59■■□□□ 1.85
ILF3-217ENST00000589998 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ILF3-217ENST00000589998 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.58■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.56■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 ABCA8O94911 1581 aa26.56■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.56■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 SYNJ2O15056 1496 aa26.55■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.54■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.54■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 TSPY4P0CV99 314 aa26.53■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 TSPY10P0CW01 314 aa26.53■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.53■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 NLRP13Q86W25 1043 aa26.52■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.52■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ILF3-217ENST00000589998 ATP10BO94823 1461 aa26.51■■□□□ 1.83
ILF3-217ENST00000589998 JPH4Q96JJ6 628 aa26.49■■□□□ 1.83
ILF3-217ENST00000589998 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.49■■□□□ 1.83
ILF3-217ENST00000589998 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.48■■□□□ 1.83
ILF3-217ENST00000589998 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.839e-7■■■□□ 17.3
ILF3-217ENST00000589998 PDE3BQ13370 1112 aa26.47■■□□□ 1.83
ILF3-217ENST00000589998 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ILF3-217ENST00000589998 NUP160Q12769 1436 aa26.47■■□□□ 1.83
ILF3-217ENST00000589998 FBLN2P98095 1184 aa26.46■■□□□ 1.83
ILF3-217ENST00000589998 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.42■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.41■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.41■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.4■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 PDE4AP27815 886 aa26.4■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.4■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.39■■□□□ 1.82
ILF3-217ENST00000589998 LAMC1P11047 1609 aa26.39■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.38■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.38■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 PREX2Q70Z35 1606 aa26.37■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 BACH2Q9BYV9 841 aa26.36■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 A2MP01023 1474 aa26.36■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 MS4A1P11836 297 aa26.35■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 RGL3Q3MIN7 710 aa26.35■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.35■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 UNC13BO14795 1591 aa26.34■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.34■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 PLA2R1Q13018 1463 aa26.34■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.33■■□□□ 1.81
ILF3-217ENST00000589998 INSRP06213 1382 aa26.33■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 PLIN1O60240 522 aa26.31■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 TESK2Q96S53 571 aa26.31■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 ERBINQ96RT1 1412 aa26.29■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 PANK3Q9H999 370 aa26.28■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 ERCC6Q03468 1493 aa26.27■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.27■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.27■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 CRBNQ96SW2 442 aa26.27■■□□□ 1.8
ILF3-217ENST00000589998 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.25■■□□□ 1.79
ILF3-217ENST00000589998 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.25■■□□□ 1.79
ILF3-217ENST00000589998 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.25■■□□□ 1.79
ILF3-217ENST00000589998 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
ILF3-217ENST00000589998 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.791e-8■■□□□ 13.5
ILF3-217ENST00000589998 SKAP1Q86WV1 359 aa26.21■■□□□ 1.79
ILF3-217ENST00000589998 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
ILF3-217ENST00000589998 TMF1P82094 1093 aa26.2■■□□□ 1.78
ILF3-217ENST00000589998 NEFMP07197 916 aa26.19■■□□□ 1.78
ILF3-217ENST00000589998 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.19■■□□□ 1.78
ILF3-217ENST00000589998 PLXNC1O60486 1568 aa26.18■■□□□ 1.78
ILF3-217ENST00000589998 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.17■■□□□ 1.78
ILF3-217ENST00000589998 USP35Q9P2H5 1018 aa26.16■■□□□ 1.78
ILF3-217ENST00000589998 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.16■■□□□ 1.78
ILF3-217ENST00000589998 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.15■■□□□ 1.78
ILF3-217ENST00000589998 ATP10AO60312 1499 aa26.14■■□□□ 1.78
ILF3-217ENST00000589998 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ILF3-217ENST00000589998 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.11■■□□□ 1.77
ILF3-217ENST00000589998 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.11■■□□□ 1.77
ILF3-217ENST00000589998 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.11■■□□□ 1.77
ILF3-217ENST00000589998 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.771e-24■■□□□ 12.1
ILF3-217ENST00000589998 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.1■■□□□ 1.77
ILF3-217ENST00000589998 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.1■■□□□ 1.77
ILF3-217ENST00000589998 IQGAP1P46940 1657 aa26.09■■□□□ 1.77
ILF3-217ENST00000589998 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.09■■□□□ 1.77
ILF3-217ENST00000589998 PPP2R1AP30153 589 aa26.06■■□□□ 1.76
ILF3-217ENST00000589998 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.06■■□□□ 1.76
ILF3-217ENST00000589998 MADDQ8WXG6 1647 aa26.06■■□□□ 1.76
ILF3-217ENST00000589998 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.767e-6■■□□□ 11.4
ILF3-217ENST00000589998 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.04■■□□□ 1.76
ILF3-217ENST00000589998 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ILF3-217ENST00000589998 ZNF521Q96K83 1311 aa26.03■■□□□ 1.76
ILF3-217ENST00000589998 SYNMO15061 1565 aa26.03■■□□□ 1.76
ILF3-217ENST00000589998 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.01■■□□□ 1.75
ILF3-217ENST00000589998 IL27Q8NEV9 243 aa26.01■■□□□ 1.75
ILF3-217ENST00000589998 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA2Q08379 1002 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms