RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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RPS6KL1-209ENST00000555009 KDM5CP41229 1560 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS6KL1-209ENST00000555009 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.09■■□□□ 1.61
RPS6KL1-209ENST00000555009 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1-209ENST00000555009 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RPS6KL1-209ENST00000555009 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RPS6KL1-209ENST00000555009 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.03■■□□□ 1.6
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.02■■□□□ 1.6
RPS6KL1-209ENST00000555009 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.01■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMC1Q8TDI8 760 aa25.01■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.01■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.01■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 RSPH4AQ5TD94 716 aa25■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.98■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.98■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.98■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.97■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.97■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLCH2O75038 1416 aa24.95■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLXNC1O60486 1568 aa24.92■■□□□ 1.58
RPS6KL1-209ENST00000555009 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RPS6KL1-209ENST00000555009 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.91■■□□□ 1.58
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.91■■□□□ 1.58
RPS6KL1-209ENST00000555009 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
RPS6KL1-209ENST00000555009 UNC13BO14795 1591 aa24.9■■□□□ 1.58
RPS6KL1-209ENST00000555009 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
RPS6KL1-209ENST00000555009 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.89■■□□□ 1.58
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCC1P33527 1531 aa24.89■■□□□ 1.58
RPS6KL1-209ENST00000555009 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.88■■□□□ 1.57
RPS6KL1-209ENST00000555009 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RPS6KL1-209ENST00000555009 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RPS6KL1-209ENST00000555009 RALBP1Q15311 655 aa24.88■■□□□ 1.57
RPS6KL1-209ENST00000555009 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.87■■□□□ 1.57
RPS6KL1-209ENST00000555009 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.86■■□□□ 1.57
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RPS6KL1-209ENST00000555009 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.83■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLA2R1Q13018 1463 aa24.83■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.81■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 E9PCH4 1651 aa24.81■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.8■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 AFAP1Q8N556 730 aa24.79■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.79■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 ERBINQ96RT1 1412 aa24.77■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 NBR1Q14596 966 aa24.77■■□□□ 1.56
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.76■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 RGL3Q3MIN7 710 aa24.75■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 NLRP13Q86W25 1043 aa24.75■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.74■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.73■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.73■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.73■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.72■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 FANCAO15360 1455 aa24.71■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.71■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
RPS6KL1-209ENST00000555009 PDE3BQ13370 1112 aa24.7■■□□□ 1.54
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.7■■□□□ 1.54
RPS6KL1-209ENST00000555009 A2MP01023 1474 aa24.69■■□□□ 1.54
RPS6KL1-209ENST00000555009 ASXL2Q76L83 1435 aa24.69■■□□□ 1.54
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.68■■□□□ 1.54
RPS6KL1-209ENST00000555009 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
RPS6KL1-209ENST00000555009 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
RPS6KL1-209ENST00000555009 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.64■■□□□ 1.54
RPS6KL1-209ENST00000555009 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.64■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 OSCARQ8IYS5 282 aa24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATP7AQ04656 1500 aa24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATP10AO60312 1499 aa24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADGRL1O94910 1474 aa24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.61■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.6■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.59■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RPS6KL1-209ENST00000555009 PDE4AP27815 886 aa24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 DEPDC5O75140 1603 aa24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 TESK2Q96S53 571 aa24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 INSRP06213 1382 aa24.55■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 MS4A1P11836 297 aa24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 LAMC1P11047 1609 aa24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 BACH2Q9BYV9 841 aa24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 PANK3Q9H999 370 aa24.53■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.52■■□□□ 1.52
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF3BO15066 747 aa24.51■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLIN1O60240 522 aa24.51■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.51■■□□□ 1.51
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