RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.31□□□□□ -0.76
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PTPRB-209ENST00000550857 NLRP6P59044 892 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-209ENST00000550857 BECN1Q14457 450 aa10.18□□□□□ -0.78
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PTPRB-209ENST00000550857 GOLGA6L22H0YM25 854 aa10.18□□□□□ -0.78
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PTPRB-209ENST00000550857 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.17□□□□□ -0.78
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