RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	TAF3	Q5VWG9	929 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	CUX1	P39880	1505 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351		E9PSI1	815 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	CBX1	P83916	185 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	USP19	O94966	1318 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		9.95	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	SEC24B	O95487	1268 aa		9.95	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	RGS22	Q8NE09	1264 aa		9.95	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		9.95	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		9.95	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		9.95	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		9.94	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	9.94	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		9.94	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		9.94	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		9.94	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	PDE3B	Q13370	1112 aa		9.93	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	CERS3	Q8IU89	383 aa		9.93	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		9.93	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	NES	P48681	1621 aa		9.92	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	IGSF3	O75054	1194 aa		9.92	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		9.92	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		9.92	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	UACA	Q9BZF9	1416 aa		9.91	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP2B3	Q16720	1220 aa		9.91	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		9.91	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		9.91	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	9.9	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	9.9	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	9.9	□□□□□ -0.82
ZNF438-208	ENST00000538351	KCNJ4	P48050	445 aa		9.9	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		9.89	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	PANK3	Q9H999	370 aa		9.89	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	9.89	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	9.89	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	KIF27	Q86VH2	1401 aa		9.89	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		9.88	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	HS1BP3	Q53T59	392 aa		9.88	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	9.87	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	NLRP1	Q9C000	1473 aa		9.87	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	TSC1	Q92574	1164 aa		9.87	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	PRX	Q9BXM0	1461 aa		9.87	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	TIAM1	Q13009	1591 aa		9.86	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		9.86	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		9.86	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		9.86	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	9.86	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC20A2	Q08357	652 aa		9.86	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		9.85	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		9.85	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		9.85	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR62	O43379	1518 aa		9.85	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		9.85	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		9.85	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		9.84	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	P3H3	Q8IVL6	736 aa		9.84	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		9.84	□□□□□ -0.83
ZNF438-208	ENST00000538351	GBP4	Q96PP9	640 aa		9.83	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	ZBTB9	Q96C00	473 aa		9.83	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	9.83	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	IGF1R	P08069	1367 aa		9.83	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	CNPY4	Q8N129	248 aa		9.83	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	9.83	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		9.83	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		9.82	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	TOPBP1	Q92547	1522 aa		9.82	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		9.82	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	MCM5	P33992	734 aa		9.82	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		9.82	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		9.82	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM177B	A6PVY3	158 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ZNF438-208	ENST00000538351	APP	P05067	770 aa		9.81	□□□□□ -0.84

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