RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530483.1

TTC17-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 2

Gene TTC17, Length 456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-211ENST00000530483 WBP1LQ9NX94 342 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC17-211ENST00000530483 SCRIBQ14160 1630 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC17-211ENST00000530483 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC17-211ENST00000530483 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TTC17-211ENST00000530483 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC17-211ENST00000530483 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC17-211ENST00000530483 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC17-211ENST00000530483 EVI5O60447 810 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC17-211ENST00000530483 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC17-211ENST00000530483 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC17-211ENST00000530483 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TTC17-211ENST00000530483 PROX2Q3B8N5 592 aa6.49□□□□□ -1.37
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TTC17-211ENST00000530483 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 COL9A1P20849 921 aa6.45□□□□□ -1.38
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TTC17-211ENST00000530483 LRCH3Q96II8 777 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.45□□□□□ -1.38
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TTC17-211ENST00000530483 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 MAP3K9P80192 1104 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 PDE4AP27815 886 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 PHF14O94880 888 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 PKD2Q13563 968 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC17-211ENST00000530483 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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TTC17-211ENST00000530483 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.35□□□□□ -1.39
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TTC17-211ENST00000530483 NCAPD3P42695 1498 aa6.32□□□□□ -1.4
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TTC17-211ENST00000530483 ZNF516Q92618 1163 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC17-211ENST00000530483 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC17-211ENST00000530483 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC17-211ENST00000530483 STK17AQ9UEE5 414 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC17-211ENST00000530483 POTECB2RU33 542 aa6.27□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 PRR20EP86478 221 aa6.26□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 PRR20CP86479 221 aa6.26□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 PRR20DP86480 221 aa6.26□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 PRR20BP86481 221 aa6.26□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 PRR20AP86496 221 aa6.26□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.26□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 NECTIN2Q92692 538 aa6.26□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 TSKSQ9UJT2 592 aa6.26□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.25□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 SMARCA2P51531 1590 aa6.24□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 SLC19A1P41440 591 aa6.24□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 SMARCA4P51532 1647 aa6.23□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.23□□□□□ -1.41
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TTC17-211ENST00000530483 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
TTC17-211ENST00000530483 SPRYD7Q5W111 196 aa6.21□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 HMGXB3Q12766 1538 aa6.2□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 FAM187AA6NFU0 413 aa6.2□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 NBPF26B4DH59 902 aa6.2□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 WFS1O76024 890 aa6.2□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.2□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.19□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 C3orf80F5H4A9 247 aa6.19□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 SMAPO00193 183 aa6.19□□□□□ -1.42
TTC17-211ENST00000530483 MAP3K7O43318 606 aa6.19□□□□□ -1.42
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