RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529045.1

PTPN22-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 4

Gene PTPN22, Length 527 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-208	ENST00000529045	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPN22-208	ENST00000529045	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPN22-208	ENST00000529045	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PTPN22-208	ENST00000529045	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPN22-208	ENST00000529045	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PTPN22-208	ENST00000529045	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PTPN22-208	ENST00000529045	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	GRIN2B	Q13224	1484 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PTPN22-208	ENST00000529045	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	EMP3	P54852	163 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	SOGA1	O94964	1423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	KDM6B	O15054	1643 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	SHROOM2	Q13796	1616 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN22-208	ENST00000529045	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	MAPKBP1	O60336	1514 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	ZMYND10	O75800	440 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	DSG2	Q14126	1118 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	DIP2B	Q9P265	1576 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PTPN22-208	ENST00000529045	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	DPYSL4	O14531	572 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	NUP160	Q12769	1436 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	FOXK1	P85037	733 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	NEUROD1	Q13562	356 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	PDIA6	Q15084	440 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	KIF3C	O14782	793 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPN22-208	ENST00000529045	C2orf72	A6NCS6	295 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	CUX1	P39880	1505 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	GPR153	Q6NV75	609 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	ERBB3	P21860	1342 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	TSPOAP1	O95153	1857 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	ADGRL1	O94910	1474 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	ARSI	Q5FYB1	569 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	PLPP6	Q8IY26	295 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	10.98	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	FBXO41	Q8TF61	875 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	GPR37	O15354	613 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
PTPN22-208	ENST00000529045	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.95	□□□□□ -0.66
PTPN22-208	ENST00000529045	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		10.94	□□□□□ -0.66
PTPN22-208	ENST00000529045	EEA1	Q15075	1411 aa		10.93	□□□□□ -0.66
PTPN22-208	ENST00000529045	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
PTPN22-208	ENST00000529045	TOP2B	Q02880	1626 aa		10.92	□□□□□ -0.66
PTPN22-208	ENST00000529045	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.92	□□□□□ -0.66
PTPN22-208	ENST00000529045	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		10.92	□□□□□ -0.66
PTPN22-208	ENST00000529045	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.92	□□□□□ -0.66
PTPN22-208	ENST00000529045	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66

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