RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 ERCC6Q03468 1493 aa28.93■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 RALBP1Q15311 655 aa28.92■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.88■■■□□ 2.21
TMEM200B-202ENST00000521452 NUP160Q12769 1436 aa28.87■■■□□ 2.21
TMEM200B-202ENST00000521452 PTPRGP23470 1445 aa28.87■■■□□ 2.21
TMEM200B-202ENST00000521452 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCA8O94911 1581 aa28.84■■■□□ 2.21
TMEM200B-202ENST00000521452 RGL3Q3MIN7 710 aa28.84■■■□□ 2.21
TMEM200B-202ENST00000521452 NBR1Q14596 966 aa28.83■■■□□ 2.21
TMEM200B-202ENST00000521452 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
TMEM200B-202ENST00000521452 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
TMEM200B-202ENST00000521452 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.82■■■□□ 2.2
TMEM200B-202ENST00000521452 NLRP13Q86W25 1043 aa28.8■■■□□ 2.2
TMEM200B-202ENST00000521452 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.8■■■□□ 2.2
TMEM200B-202ENST00000521452 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.79■■■□□ 2.2
TMEM200B-202ENST00000521452 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.79■■■□□ 2.2
TMEM200B-202ENST00000521452 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
TMEM200B-202ENST00000521452 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.77■■■□□ 2.2
TMEM200B-202ENST00000521452 E9PCH4 1651 aa28.76■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.76■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.76■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.76■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.73■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
TMEM200B-202ENST00000521452 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
TMEM200B-202ENST00000521452 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.68■■■□□ 2.18
TMEM200B-202ENST00000521452 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.67■■■□□ 2.18
TMEM200B-202ENST00000521452 PDE3BQ13370 1112 aa28.67■■■□□ 2.18
TMEM200B-202ENST00000521452 PLA2R1Q13018 1463 aa28.66■■■□□ 2.18
TMEM200B-202ENST00000521452 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.66■■■□□ 2.18
TMEM200B-202ENST00000521452 TESK2Q96S53 571 aa28.65■■■□□ 2.18
TMEM200B-202ENST00000521452 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.64■■■□□ 2.18
TMEM200B-202ENST00000521452 A2MP01023 1474 aa28.63■■■□□ 2.17
TMEM200B-202ENST00000521452 PANK3Q9H999 370 aa28.63■■■□□ 2.17
TMEM200B-202ENST00000521452 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TMEM200B-202ENST00000521452 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.62■■■□□ 2.17
TMEM200B-202ENST00000521452 PLIN1O60240 522 aa28.62■■■□□ 2.17
TMEM200B-202ENST00000521452 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.62■■■□□ 2.17
TMEM200B-202ENST00000521452 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
TMEM200B-202ENST00000521452 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
TMEM200B-202ENST00000521452 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.58■■■□□ 2.17
TMEM200B-202ENST00000521452 PDE4AP27815 886 aa28.57■■■□□ 2.16
TMEM200B-202ENST00000521452 PREX2Q70Z35 1606 aa28.56■■■□□ 2.16
TMEM200B-202ENST00000521452 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.56■■■□□ 2.16
TMEM200B-202ENST00000521452 ERBINQ96RT1 1412 aa28.54■■■□□ 2.16
TMEM200B-202ENST00000521452 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.53■■■□□ 2.16
TMEM200B-202ENST00000521452 TMF1P82094 1093 aa28.53■■■□□ 2.16
TMEM200B-202ENST00000521452 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.51■■■□□ 2.16
TMEM200B-202ENST00000521452 BACH2Q9BYV9 841 aa28.5■■■□□ 2.15
TMEM200B-202ENST00000521452 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TMEM200B-202ENST00000521452 SKAP1Q86WV1 359 aa28.49■■■□□ 2.15
TMEM200B-202ENST00000521452 UNC13BO14795 1591 aa28.49■■■□□ 2.15
TMEM200B-202ENST00000521452 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
TMEM200B-202ENST00000521452 CRBNQ96SW2 442 aa28.48■■■□□ 2.15
TMEM200B-202ENST00000521452 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.46■■■□□ 2.15
TMEM200B-202ENST00000521452 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.46■■■□□ 2.15
TMEM200B-202ENST00000521452 MS4A1P11836 297 aa28.45■■■□□ 2.15
TMEM200B-202ENST00000521452 LAMC1P11047 1609 aa28.43■■■□□ 2.14
TMEM200B-202ENST00000521452 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
TMEM200B-202ENST00000521452 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.42■■■□□ 2.14
TMEM200B-202ENST00000521452 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.42■■■□□ 2.14
TMEM200B-202ENST00000521452 INSRP06213 1382 aa28.42■■■□□ 2.14
TMEM200B-202ENST00000521452 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.41■■■□□ 2.14
TMEM200B-202ENST00000521452 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.41■■■□□ 2.14
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 ATP10AO60312 1499 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 PPP2R1AP30153 589 aa28.35■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 PLXNC1O60486 1568 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM200B-202ENST00000521452 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
TMEM200B-202ENST00000521452 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TMEM200B-202ENST00000521452 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.3■■■□□ 2.12
TMEM200B-202ENST00000521452 NEFMP07197 916 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM200B-202ENST00000521452 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.25■■■□□ 2.11
TMEM200B-202ENST00000521452 GOLGA2Q08379 1002 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF521Q96K83 1311 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM200B-202ENST00000521452 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.22■■■□□ 2.11
TMEM200B-202ENST00000521452 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM200B-202ENST00000521452 PLCH2O75038 1416 aa28.2■■■□□ 2.11
TMEM200B-202ENST00000521452 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.2■■■□□ 2.11
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC2Q92887 1545 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 CDCA8Q53HL2 280 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 MADDQ8WXG6 1647 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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