RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.72□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.72□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.71□□□□□ -0.21
TRPS1-211ENST00000520276 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.71□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.71□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 ABCC5O15440 1437 aa13.7□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.68□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 PKD2Q13563 968 aa13.67□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 PKNOX2Q96KN3 472 aa13.67□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 WASHC2AQ641Q2 1341 aa13.67□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.67□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 ATP10AO60312 1499 aa13.65□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 A2MP01023 1474 aa13.65□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 PREX2Q70Z35 1606 aa13.65□□□□□ -0.22
TRPS1-211ENST00000520276 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.64□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.64□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.64□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.63□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.63□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 RGL3Q3MIN7 710 aa13.63□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 MPHOSPH9Q99550 1183 aa13.63□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 NCOA1Q15788 1441 aa13.62□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.62□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 ROCK1Q13464 1354 aa13.62□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.62□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 NEFMP07197 916 aa13.61□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 ABCC1P33527 1531 aa13.61□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.6□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.6□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 ATP7AQ04656 1500 aa13.6□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.59□□□□□ -0.23
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TRPS1-211ENST00000520276 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.59□□□□□ -0.23
TRPS1-211ENST00000520276 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.58□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 MBD5Q9P267 1494 aa13.58□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC184Q52MB2 194 aa13.58□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.58□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 EID1Q9Y6B2 187 aa13.58□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.56□□□□□ -0.24
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TRPS1-211ENST00000520276 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.55□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.55□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.55□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 TONSLQ96HA7 1378 aa13.55□□□□□ -0.24
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TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.54□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.54□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 KIF13AQ9H1H9 1805 aa13.54□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 NAIPQ13075 1403 aa13.52□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 ERBINQ96RT1 1412 aa13.52□□□□□ -0.24
TRPS1-211ENST00000520276 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TRPS1-211ENST00000520276 PTPRKQ15262 1439 aa13.52□□□□□ -0.25
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TRPS1-211ENST00000520276 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TRPS1-211ENST00000520276 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.5□□□□□ -0.25
TRPS1-211ENST00000520276 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.5□□□□□ -0.25
TRPS1-211ENST00000520276 ZMYM3Q14202 1370 aa13.48□□□□□ -0.25
TRPS1-211ENST00000520276 C14orf37Q86TY3 774 aa13.48□□□□□ -0.25
TRPS1-211ENST00000520276 USP35Q9P2H5 1018 aa13.48□□□□□ -0.25
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.48□□□□□ -0.25
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TRPS1-211ENST00000520276 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.46□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 GSE1Q14687 1217 aa13.45□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRL2O95490 1459 aa13.45□□□□□ -0.26
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TRPS1-211ENST00000520276 TNRQ92752 1358 aa13.44□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 POLR3GLQ9BT43 218 aa13.44□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.44□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.44□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 ZMYND15Q9H091 742 aa13.43□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 RSPH6AQ9H0K4 717 aa13.42□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.42□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.41□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.41□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 IDI1Q13907 227 aa13.4□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.4□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 KDM5CP41229 1560 aa13.4□□□□□ -0.26
TRPS1-211ENST00000520276 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.39□□□□□ -0.27
TRPS1-211ENST00000520276 HSPA2P54652 639 aa13.39□□□□□ -0.27
TRPS1-211ENST00000520276 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.38□□□□□ -0.27
TRPS1-211ENST00000520276 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TRPS1-211ENST00000520276 MRS2Q9HD23 443 aa13.38□□□□□ -0.27
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