RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 FGD1P98174 961 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 FKBP8Q14318 412 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.58□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.58□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.57□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 PLCH2O75038 1416 aa10.57□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 PZPP20742 1482 aa10.57□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC7Q96M83 1385 aa10.56□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 RAPGEF3O95398 923 aa10.56□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.56□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 MLECQ14165 292 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 ZMYND15Q9H091 742 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 FANCAO15360 1455 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 MBD5Q9P267 1494 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 ASXL2Q76L83 1435 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRL2O95490 1459 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 MSH5O43196 834 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 FAM69CQ0P6D2 419 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRL1O94910 1474 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-208ENST00000519076 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 TMF1P82094 1093 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 CD109Q6YHK3 1445 aa10.51□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.51□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 CNTLNQ9NXG0 1405 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC184Q52MB2 194 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 AAMPQ13685 434 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 PREX2Q70Z35 1606 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 IL27Q8NEV9 243 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 CDCA8Q53HL2 280 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 SHROOM2Q13796 1616 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 PANK3Q9H999 370 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 STK26Q9P289 416 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 ERBINQ96RT1 1412 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.41□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.41□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.4□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 RALBP1Q15311 655 aa10.4□□□□□ -0.74
TRPS1-208ENST00000519076 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.39□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC1P33527 1531 aa10.39□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.38□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.38□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP13Q86W25 1043 aa10.38□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 POGKQ9P215 609 aa10.38□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.37□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.37□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 ATP7AQ04656 1500 aa10.37□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.37□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 A2MP01023 1474 aa10.36□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 STAC3Q96MF2 364 aa10.36□□□□□ -0.75
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