RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 MSH5O43196 834 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC4A3P48751 1232 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CRBNQ96SW2 442 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 MORC1Q86VD1 984 aa16.66■□□□□ 0.26
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RABGEF1-211ENST00000503687 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.65■□□□□ 0.26
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RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.64■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.64■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.63■□□□□ 0.25
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RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA2Q08379 1002 aa16.63■□□□□ 0.25
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RABGEF1-211ENST00000503687 APAF1O14727 1248 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAMTS12P58397 1594 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 PDE4AP27815 886 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 CFAP53Q96M91 514 aa16.61■□□□□ 0.25
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RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHG5O94827 1062 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 KANK1Q14678 1352 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 POGKQ9P215 609 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 DDRGK1Q96HY6 314 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 PDE3BQ13370 1112 aa16.58■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
RABGEF1-211ENST00000503687 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 NCOA1Q15788 1441 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 DISP1Q96F81 1524 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 ROCK1Q13464 1354 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 PBRM1Q86U86 1689 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP10BO94823 1461 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 SOX12O15370 315 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA0556O60303 1618 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR62O43379 1518 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 COG6Q9Y2V7 657 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 SAMD9Q5K651 1589 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP2R1AP30153 589 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 RAPGEF3O95398 923 aa16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 BECN1Q14457 450 aa16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 BCAR3O75815 825 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 PANK1Q8TE04 598 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CEP170Q5SW79 1584 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.221e-6■■■□□ 15.1
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RABGEF1-211ENST00000503687 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF14Q15058 1648 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 NUTM2FA1L443 756 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 NUP160Q12769 1436 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 C14orf37Q86TY3 774 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 APBB1O00213 710 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 KDM6BO15054 1643 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 E9PSI1 815 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 MTHFSP49914 203 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM161AQ3B820 660 aa16.35■□□□□ 0.21
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