RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC24A1O60721 1099 aa7.57□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.56□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.56□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 OSBPP22059 807 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 TK2O00142 265 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 SEMA3EO15041 775 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 MAP3K7O43318 606 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 COL9A1P20849 921 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 MMRN1Q13201 1228 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 NISCHQ9Y2I1 1504 aa7.49□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 HRO43593 1189 aa7.49□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.48□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 PROX2Q3B8N5 592 aa7.47□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.47□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 STAC3Q96MF2 364 aa7.47□□□□□ -1.21
ANKRD28-211ENST00000492895 CERKQ8TCT0 537 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.44□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.44□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.44□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 NUTM2FA1L443 756 aa7.43□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 PRSS12P56730 875 aa7.43□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.43□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 NBPF3Q9H094 633 aa7.43□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 PTGDRQ13258 359 aa7.41□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 PACS2Q86VP3 889 aa7.41□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 TSKSQ9UJT2 592 aa7.41□□□□□ -1.22
ANKRD28-211ENST00000492895 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.39□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 FCHSD2O94868 740 aa7.39□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.39□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.38□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC13Q8NBP0 860 aa7.38□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 PADI6Q6TGC4 694 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 TATDN2Q93075 761 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 WNT2BQ93097 391 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 NBPF26B4DH59 902 aa7.35□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 C3orf80F5H4A9 247 aa7.35□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 SMAPO00193 183 aa7.35□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.34□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 PNMA3Q9UL41 463 aa7.34□□□□□ -1.23
ANKRD28-211ENST00000492895 HIC1Q14526 733 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 HCSTQ9UBK5 93 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR37O15354 613 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 GNPATO15228 680 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 EYA1Q99502 592 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 PTPN5P54829 565 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 FECHP22830 423 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 BCAMP50895 628 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM161AQ3B820 660 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 LRCH3Q96II8 777 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-211ENST00000492895 OATP04181 439 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 RCCD1A6NED2 376 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 DNAJB2P25686 324 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 BCANQ96GW7 911 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 WBP1LQ9NX94 342 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP4CP60510 307 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 MAP2K5Q13163 448 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-211ENST00000492895 IRF6O14896 467 aa7.21□□□□□ -1.26
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