RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.47■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.47■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.47■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.46■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.45■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 KIF21BO75037 1637 aa21.45■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 APBB1O00213 710 aa21.45■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.45■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 GPATCH3Q96I76 525 aa21.45■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.44■■□□□ 1.02
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NISCH-213ENST00000489895 NUTM2FA1L443 756 aa21.43■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 IFT140Q96RY7 1462 aa21.42■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 HMGXB3Q12766 1538 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 NGEFQ8N5V2 710 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 PRDM2Q13029 1718 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 SYNJ2O15056 1496 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-213ENST00000489895 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
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NISCH-213ENST00000489895 NCOA2Q15596 1464 aa21.39■■□□□ 1.01
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NISCH-213ENST00000489895 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.38■■□□□ 1.01
NISCH-213ENST00000489895 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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NISCH-213ENST00000489895 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.36■■□□□ 1.01
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NISCH-213ENST00000489895 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-213ENST00000489895 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-213ENST00000489895 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-213ENST00000489895 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-213ENST00000489895 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
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NISCH-213ENST00000489895 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
NISCH-213ENST00000489895 MIA2Q96PC5 1412 aa21.33■■□□□ 1
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-213ENST00000489895 GBP4Q96PP9 640 aa21.31■■□□□ 1
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NISCH-213ENST00000489895 TOPBP1Q92547 1522 aa21.3■■□□□ 1
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NISCH-213ENST00000489895 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.29■■□□□ 1
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NISCH-213ENST00000489895 SYNJ1O43426 1573 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-213ENST00000489895 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.28■■□□□ 1
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NISCH-213ENST00000489895 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
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NISCH-213ENST00000489895 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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NISCH-213ENST00000489895 CCDC7Q96M83 1385 aa21.2■□□□□ 0.98
NISCH-213ENST00000489895 APAF1O14727 1248 aa21.2■□□□□ 0.98
NISCH-213ENST00000489895 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.19■□□□□ 0.98
NISCH-213ENST00000489895 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
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NISCH-213ENST00000489895 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.17■□□□□ 0.98
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NISCH-213ENST00000489895 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-213ENST00000489895 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.16■□□□□ 0.98
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NISCH-213ENST00000489895 ATF3P18847 181 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-213ENST00000489895 RIPK4P57078 832 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-213ENST00000489895 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-213ENST00000489895 KIF3AQ9Y496 699 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-213ENST00000489895 ST18O60284 1047 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-213ENST00000489895 HECW1Q76N89 1606 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
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