RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487258.5

AKAP9-211, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 2

Gene AKAP9, Length 3,983 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-211ENST00000487258 FAM69CQ0P6D2 419 aa13.57□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.57□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 CCDC7Q96M83 1385 aa13.56□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.56□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.56□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.56□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.56□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 ERBINQ96RT1 1412 aa13.56□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.55□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 KIF7Q2M1P5 1343 aa13.54□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 RAPGEF3O95398 923 aa13.53□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 TMC1Q8TDI8 760 aa13.53□□□□□ -0.24
AKAP9-211ENST00000487258 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.52□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 TMF1P82094 1093 aa13.52□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.51□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 ABCC1P33527 1531 aa13.51□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.51□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.51□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 CDCA8Q53HL2 280 aa13.5□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.48□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 MLECQ14165 292 aa13.48□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.47□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.47□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 STAC3Q96MF2 364 aa13.47□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 ATP7AQ04656 1500 aa13.46□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
AKAP9-211ENST00000487258 BCANQ96GW7 911 aa13.45□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.45□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.45□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 PLXNC1O60486 1568 aa13.44□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 A2MP01023 1474 aa13.43□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.43□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 SLC24A1O60721 1099 aa13.42□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 FKBP8Q14318 412 aa13.42□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 RALGAPBQ86X10 1494 aa13.42□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.4□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.4□□□□□ -0.26
AKAP9-211ENST00000487258 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.39□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.39□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 RALBP1Q15311 655 aa13.38□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.38□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.38□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 UNC13BO14795 1591 aa13.37□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.37□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.37□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 NEO1Q92859 1461 aa13.36□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 PANK3Q9H999 370 aa13.35□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.35□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.35□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.35□□□□□ -0.27
AKAP9-211ENST00000487258 PLA2R1Q13018 1463 aa13.33□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP13.33□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.33□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 STK26Q9P289 416 aa13.32□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 POGKQ9P215 609 aa13.32□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 NLRP13Q86W25 1043 aa13.31□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.3□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 CCDC184Q52MB2 194 aa13.3□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.3□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 ATP10AO60312 1499 aa13.3□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.29□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.28□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.28□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
AKAP9-211ENST00000487258 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.27□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.27□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 TRPM2O94759 1503 aa13.26□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 NOS1P29475 1434 aa13.26□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 TET3O43151 1660 aa13.25□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 KDM5CP41229 1560 aa13.25□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 PTPRTO14522 1441 aa13.25□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 IDI1Q13907 227 aa13.25□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.24□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.24□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.23□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.23□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 TESK2Q96S53 571 aa13.23□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.23□□□□□ -0.29
AKAP9-211ENST00000487258 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.8 ms