RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 HRO43593 1189 aa6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 C14orf37Q86TY3 774 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.27□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.26□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.26□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 DPYSL4O14531 572 aa6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 PHF14O94880 888 aa6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 CAMK2BQ13554 666 aa6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 FBXW7Q969H0 707 aa6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.25□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 NBPF3Q9H094 633 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 PTPN5P54829 565 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 EPAS1Q99814 870 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 WDR70Q9NW82 654 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-205ENST00000460278 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 WNT2BQ93097 391 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 DDX12PQ92771 950 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 COL9A1P20849 921 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 PROX2Q3B8N5 592 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 P3H3Q8IVL6 736 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 E2F4Q16254 413 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 PDIA6Q15084 440 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 MAP3K7O43318 606 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.15□□□□□ -1.42
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.14□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 BCAMP50895 628 aa6.12□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.11□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 PACS2Q86VP3 889 aa6.11□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 CERKQ8TCT0 537 aa6.1□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 LRCH3Q96II8 777 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ANKRD28-205ENST00000460278 IFFO2Q5TF58 517 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 TSKSQ9UJT2 592 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 PRSS12P56730 875 aa6.07□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.07□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 WBP1LQ9NX94 342 aa6.07□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 NBPF26B4DH59 902 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A0G2JS52 829 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 SMAPO00193 183 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 OSBPP22059 807 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 PNMA3Q9UL41 463 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 RGS20O76081 388 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP4CP60510 307 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 TATDN2Q93075 761 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-205ENST00000460278 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 RNF40O75150 1001 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNC4Q03721 635 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 NEUROD2Q15784 382 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNV2Q8TDN2 545 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 PADI6Q6TGC4 694 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 C3orf80F5H4A9 247 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC4A3P48751 1232 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 NECTIN2Q92692 538 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-205ENST00000460278 SLF2Q8IX21 1173 aa5.96□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 NUTM2FA1L443 756 aa5.95□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms