RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.53□□□□□ -1.04
CBX1-204ENST00000444685 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CBX1-204ENST00000444685 SLC39A7Q92504 469 aa8.53□□□□□ -1.04
CBX1-204ENST00000444685 PLCH2O75038 1416 aa8.53□□□□□ -1.04
CBX1-204ENST00000444685 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.53□□□□□ -1.04
CBX1-204ENST00000444685 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.53□□□□□ -1.04
CBX1-204ENST00000444685 AFAP1Q8N556 730 aa8.52□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.52□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.52□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 HECW1Q76N89 1606 aa8.51□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 SAMD9Q5K651 1589 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 STRCQ7RTU9 1775 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 TOM1O60784 492 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 PKD2Q13563 968 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 ST18O60284 1047 aa8.47□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CBX1-204ENST00000444685 PIP4K2BP78356 416 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 CLIP1P30622 1438 aa8.45□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.44□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.44□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.43□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 HSPA1LP34931 641 aa8.43□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 ZMYM3Q14202 1370 aa8.43□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 NCOA1Q15788 1441 aa8.43□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 FMN1Q68DA7 1419 aa8.43□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.42□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 EEA1Q15075 1411 aa8.42□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.41□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.41□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 NPATQ14207 1427 aa8.41□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 GGT6Q6P531 493 aa8.41□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 PHF12Q96QT6 1004 aa8.41□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.4□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CBX1-204ENST00000444685 C3P01024 1663 aa8.4□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 AGLP35573 1532 aa8.39□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.38□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 KIF14Q15058 1648 aa8.38□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 KDM5CP41229 1560 aa8.37□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 REREQ9P2R6 1566 aa8.37□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 POTEFA5A3E0 1075 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 FBXO3Q9UK99 471 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 PTPRKQ15262 1439 aa8.35□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 PLA2R1Q13018 1463 aa8.34□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CBX1-204ENST00000444685 ABCA6Q8N139 1617 aa8.32□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 CPS1P31327 1500 aa8.31□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.31□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 MROH2AA6NES4 1674 aa8.3□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.3□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.3□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.3□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 KIF3BO15066 747 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 A2MP01023 1474 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 ABCC1P33527 1531 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 TNRQ92752 1358 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 PROM2Q8N271 834 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
CBX1-204ENST00000444685 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.27□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.27□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 PREX2Q70Z35 1606 aa8.26□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.26□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.26□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.26□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 ATP7AQ04656 1500 aa8.25□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.25□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CBX1-204ENST00000444685 TSPY4P0CV99 314 aa8.25□□□□□ -1.09
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