RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-202ENST00000420808 SHROOM2Q13796 1616 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-202ENST00000420808 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NISCH-202ENST00000420808 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.26■□□□□ 0.99
NISCH-202ENST00000420808 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.26■□□□□ 0.99
NISCH-202ENST00000420808 ABCC2Q92887 1545 aa21.25■□□□□ 0.99
NISCH-202ENST00000420808 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.23■□□□□ 0.99
NISCH-202ENST00000420808 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
NISCH-202ENST00000420808 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.22■□□□□ 0.99
NISCH-202ENST00000420808 A2MP01023 1474 aa21.22■□□□□ 0.99
NISCH-202ENST00000420808 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.22■□□□□ 0.99
NISCH-202ENST00000420808 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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NISCH-202ENST00000420808 UNC13BO14795 1591 aa21.21■□□□□ 0.99
NISCH-202ENST00000420808 TMC1Q8TDI8 760 aa21.2■□□□□ 0.98
NISCH-202ENST00000420808 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.19■□□□□ 0.98
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NISCH-202ENST00000420808 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.18■□□□□ 0.98
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NISCH-202ENST00000420808 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.14■□□□□ 0.98
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NISCH-202ENST00000420808 ERBINQ96RT1 1412 aa21.05■□□□□ 0.96
NISCH-202ENST00000420808 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
NISCH-202ENST00000420808 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
NISCH-202ENST00000420808 RALBP1Q15311 655 aa21.05■□□□□ 0.96
NISCH-202ENST00000420808 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
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NISCH-202ENST00000420808 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
NISCH-202ENST00000420808 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.01■□□□□ 0.95
NISCH-202ENST00000420808 ATP10AO60312 1499 aa21■□□□□ 0.95
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NISCH-202ENST00000420808 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
NISCH-202ENST00000420808 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
NISCH-202ENST00000420808 CLTCL1P53675 1640 aa20.92■□□□□ 0.94
NISCH-202ENST00000420808 MADDQ8WXG6 1647 aa20.92■□□□□ 0.94
NISCH-202ENST00000420808 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.92■□□□□ 0.94
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NISCH-202ENST00000420808 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.9■□□□□ 0.94
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NISCH-202ENST00000420808 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-202ENST00000420808 FANCAO15360 1455 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-202ENST00000420808 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.89■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 TRPM2O94759 1503 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 ATP7AQ04656 1500 aa20.86■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.86■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 PTPRTO14522 1441 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 IQGAP1P46940 1657 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 CEP152O94986 1710 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 DEPDC5O75140 1603 aa20.84■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 PLIN1O60240 522 aa20.84■□□□□ 0.93
NISCH-202ENST00000420808 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.84■□□□□ 0.93
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NISCH-202ENST00000420808 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.8■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.8■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 TET3O43151 1660 aa20.8■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.8■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.79■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 ASXL2Q76L83 1435 aa20.79■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 PPP2R1AP30153 589 aa20.79■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
NISCH-202ENST00000420808 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.78■□□□□ 0.92
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