RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SMURF1-201ENST00000361125 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.5■■□□□ 1.83
SMURF1-201ENST00000361125 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SMURF1-201ENST00000361125 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SMURF1-201ENST00000361125 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
SMURF1-201ENST00000361125 PDE3BQ13370 1112 aa26.48■■□□□ 1.83
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.47■■□□□ 1.83
SMURF1-201ENST00000361125 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.46■■□□□ 1.83
SMURF1-201ENST00000361125 IGF1RP08069 1367 aa26.45■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 UACAQ9BZF9 1416 aa26.44■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 GORABQ5T7V8 394 aa26.44■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.44■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.44■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 USP47Q96K76 1375 aa26.44■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 DRC7Q8IY82 874 aa26.43■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.42■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 HMMRO75330 724 aa26.4■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.4■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 EVC2Q86UK5 1308 aa26.39■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SMURF1-201ENST00000361125 NRDCO43847 1150 aa26.39■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 GPATCH3Q96I76 525 aa26.39■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 PLIN1O60240 522 aa26.38■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 COG3Q96JB2 828 aa26.38■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.38■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 PRDM2Q13029 1718 aa26.37■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 GBP4Q96PP9 640 aa26.37■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.37■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.37■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 CLSTN1O94985 981 aa26.36■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.35■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 OSCARQ8IYS5 282 aa26.35■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.818e-7■■■■□ 22.8
SMURF1-201ENST00000361125 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SMURF1-201ENST00000361125 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SMURF1-201ENST00000361125 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.31■■□□□ 1.8
SMURF1-201ENST00000361125 PDE4AP27815 886 aa26.3■■□□□ 1.8
SMURF1-201ENST00000361125 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.3■■□□□ 1.8
SMURF1-201ENST00000361125 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.28■■□□□ 1.8
SMURF1-201ENST00000361125 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.27■■□□□ 1.8
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.27■■□□□ 1.8
SMURF1-201ENST00000361125 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SMURF1-201ENST00000361125 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.24■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 E9PSI1 815 aa26.24■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 APAF1O14727 1248 aa26.24■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 CUX1P39880 1505 aa26.24■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 CRBNQ96SW2 442 aa26.23■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 PTMSP20962 102 aa26.22■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.21■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC7Q96M83 1385 aa26.21■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.21■■□□□ 1.79
SMURF1-201ENST00000361125 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 USP35Q9P2H5 1018 aa26.2■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.19■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 COG6Q9Y2V7 657 aa26.19■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.19■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 EVA1CP58658 441 aa26.18■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 NGEFQ8N5V2 710 aa26.18■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 RILPL2Q969X0 211 aa26.18■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 NECTIN2Q92692 538 aa26.17■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.17■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 FAM161AQ3B820 660 aa26.17■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.16■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 ARAP1Q96P48 1450 aa26.16■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 SLC4A3P48751 1232 aa26.16■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 G3V3G9 751 aa26.15■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.15■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 TOMM22Q9NS69 142 aa26.15■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 SYNJ1O43426 1573 aa26.15■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 TEFQ10587 303 aa26.14■■□□□ 1.78
SMURF1-201ENST00000361125 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.13■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 NCOA2Q15596 1464 aa26.13■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 RIPK4P57078 832 aa26.13■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.11■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 PSME1Q06323 249 aa26.11■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 NCAPD3P42695 1498 aa26.1■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 ST18O60284 1047 aa26.1■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.09■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.09■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.09■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 CABP2Q9NPB3 220 aa26.08■■□□□ 1.77
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.07■■□□□ 1.76
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